Protein–RNA interactions for Protein: P52209

PGD, 6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGDP52209 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PGDP52209 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PGDP52209 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PGDP52209 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PGDP52209 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PGDP52209 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PGDP52209 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PGDP52209 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PGDP52209 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PGDP52209 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PGDP52209 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PGDP52209 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PGDP52209 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PGDP52209 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PGDP52209 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PGDP52209 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
PGDP52209 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PGDP52209 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PGDP52209 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PGDP52209 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PGDP52209 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PGDP52209 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PGDP52209 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PGDP52209 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PGDP52209 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PGDP52209 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PGDP52209 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PGDP52209 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PGDP52209 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PGDP52209 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PGDP52209 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PGDP52209 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PGDP52209 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PGDP52209 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PGDP52209 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PGDP52209 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PGDP52209 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PGDP52209 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PGDP52209 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PGDP52209 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PGDP52209 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PGDP52209 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PGDP52209 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PGDP52209 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PGDP52209 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PGDP52209 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
PGDP52209 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PGDP52209 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PGDP52209 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PGDP52209 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PGDP52209 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PGDP52209 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PGDP52209 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PGDP52209 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PGDP52209 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
PGDP52209 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PGDP52209 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PGDP52209 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PGDP52209 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
PGDP52209 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
PGDP52209 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PGDP52209 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PGDP52209 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PGDP52209 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PGDP52209 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PGDP52209 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PGDP52209 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PGDP52209 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PGDP52209 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PGDP52209 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PGDP52209 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PGDP52209 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PGDP52209 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PGDP52209 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
PGDP52209 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PGDP52209 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PGDP52209 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PGDP52209 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PGDP52209 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PGDP52209 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PGDP52209 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PGDP52209 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PGDP52209 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PGDP52209 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PGDP52209 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PGDP52209 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
PGDP52209 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PGDP52209 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PGDP52209 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PGDP52209 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PGDP52209 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PGDP52209 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PGDP52209 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PGDP52209 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PGDP52209 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PGDP52209 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PGDP52209 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PGDP52209 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PGDP52209 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PGDP52209 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.6 ms