Protein–RNA interactions for Protein: P49908

SELENOP, Selenoprotein P, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELENOPP49908 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SELENOPP49908 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SELENOPP49908 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SELENOPP49908 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SELENOPP49908 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SELENOPP49908 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SELENOPP49908 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SELENOPP49908 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SELENOPP49908 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SELENOPP49908 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SELENOPP49908 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SELENOPP49908 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SELENOPP49908 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SELENOPP49908 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SELENOPP49908 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SELENOPP49908 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SELENOPP49908 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SELENOPP49908 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SELENOPP49908 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SELENOPP49908 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SELENOPP49908 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SELENOPP49908 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SELENOPP49908 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SELENOPP49908 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SELENOPP49908 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SELENOPP49908 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SELENOPP49908 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SELENOPP49908 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SELENOPP49908 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SELENOPP49908 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SELENOPP49908 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SELENOPP49908 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SELENOPP49908 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SELENOPP49908 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SELENOPP49908 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SELENOPP49908 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SELENOPP49908 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SELENOPP49908 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SELENOPP49908 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SELENOPP49908 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SELENOPP49908 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SELENOPP49908 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SELENOPP49908 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SELENOPP49908 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SELENOPP49908 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SELENOPP49908 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SELENOPP49908 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SELENOPP49908 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SELENOPP49908 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SELENOPP49908 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SELENOPP49908 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SELENOPP49908 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SELENOPP49908 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SELENOPP49908 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SELENOPP49908 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SELENOPP49908 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SELENOPP49908 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SELENOPP49908 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SELENOPP49908 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SELENOPP49908 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SELENOPP49908 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SELENOPP49908 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SELENOPP49908 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SELENOPP49908 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SELENOPP49908 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SELENOPP49908 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SELENOPP49908 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SELENOPP49908 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SELENOPP49908 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SELENOPP49908 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SELENOPP49908 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SELENOPP49908 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SELENOPP49908 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SELENOPP49908 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SELENOPP49908 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SELENOPP49908 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SELENOPP49908 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SELENOPP49908 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SELENOPP49908 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SELENOPP49908 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SELENOPP49908 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SELENOPP49908 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SELENOPP49908 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SELENOPP49908 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SELENOPP49908 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SELENOPP49908 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SELENOPP49908 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SELENOPP49908 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SELENOPP49908 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SELENOPP49908 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SELENOPP49908 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SELENOPP49908 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SELENOPP49908 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SELENOPP49908 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SELENOPP49908 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SELENOPP49908 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SELENOPP49908 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SELENOPP49908 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SELENOPP49908 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SELENOPP49908 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms