Protein–RNA interactions for Protein: P49761

CLK3, Dual specificity protein kinase CLK3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK3P49761 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CLK3P49761 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CLK3P49761 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CLK3P49761 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CLK3P49761 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CLK3P49761 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CLK3P49761 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CLK3P49761 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CLK3P49761 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CLK3P49761 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CLK3P49761 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CLK3P49761 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CLK3P49761 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CLK3P49761 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CLK3P49761 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CLK3P49761 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CLK3P49761 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CLK3P49761 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CLK3P49761 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CLK3P49761 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CLK3P49761 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CLK3P49761 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CLK3P49761 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CLK3P49761 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CLK3P49761 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CLK3P49761 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CLK3P49761 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CLK3P49761 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CLK3P49761 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CLK3P49761 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CLK3P49761 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CLK3P49761 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CLK3P49761 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CLK3P49761 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CLK3P49761 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CLK3P49761 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CLK3P49761 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CLK3P49761 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CLK3P49761 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CLK3P49761 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
CLK3P49761 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CLK3P49761 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CLK3P49761 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CLK3P49761 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CLK3P49761 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CLK3P49761 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CLK3P49761 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CLK3P49761 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CLK3P49761 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLK3P49761 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLK3P49761 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLK3P49761 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLK3P49761 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLK3P49761 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLK3P49761 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLK3P49761 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLK3P49761 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLK3P49761 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLK3P49761 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLK3P49761 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLK3P49761 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLK3P49761 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLK3P49761 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLK3P49761 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLK3P49761 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CLK3P49761 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLK3P49761 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CLK3P49761 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CLK3P49761 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CLK3P49761 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CLK3P49761 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CLK3P49761 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CLK3P49761 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CLK3P49761 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CLK3P49761 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CLK3P49761 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CLK3P49761 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CLK3P49761 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CLK3P49761 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CLK3P49761 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CLK3P49761 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CLK3P49761 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CLK3P49761 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CLK3P49761 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CLK3P49761 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CLK3P49761 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CLK3P49761 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CLK3P49761 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CLK3P49761 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLK3P49761 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLK3P49761 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLK3P49761 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CLK3P49761 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CLK3P49761 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CLK3P49761 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CLK3P49761 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CLK3P49761 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CLK3P49761 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CLK3P49761 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLK3P49761 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms