Protein–RNA interactions for Protein: P49746

THBS3, Thrombospondin-3, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THBS3P49746 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
THBS3P49746 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
THBS3P49746 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
THBS3P49746 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
THBS3P49746 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
THBS3P49746 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
THBS3P49746 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
THBS3P49746 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
THBS3P49746 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
THBS3P49746 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
THBS3P49746 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
THBS3P49746 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
THBS3P49746 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
THBS3P49746 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
THBS3P49746 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
THBS3P49746 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
THBS3P49746 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
THBS3P49746 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
THBS3P49746 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
THBS3P49746 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
THBS3P49746 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
THBS3P49746 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
THBS3P49746 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
THBS3P49746 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
THBS3P49746 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
THBS3P49746 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
THBS3P49746 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
THBS3P49746 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
THBS3P49746 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
THBS3P49746 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
THBS3P49746 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
THBS3P49746 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
THBS3P49746 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
THBS3P49746 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
THBS3P49746 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
THBS3P49746 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
THBS3P49746 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
THBS3P49746 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
THBS3P49746 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
THBS3P49746 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
THBS3P49746 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
THBS3P49746 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
THBS3P49746 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
THBS3P49746 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
THBS3P49746 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
THBS3P49746 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
THBS3P49746 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
THBS3P49746 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
THBS3P49746 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
THBS3P49746 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
THBS3P49746 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
THBS3P49746 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
THBS3P49746 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
THBS3P49746 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
THBS3P49746 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
THBS3P49746 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
THBS3P49746 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
THBS3P49746 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
THBS3P49746 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
THBS3P49746 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
THBS3P49746 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
THBS3P49746 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
THBS3P49746 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
THBS3P49746 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
THBS3P49746 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
THBS3P49746 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
THBS3P49746 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
THBS3P49746 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
THBS3P49746 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
THBS3P49746 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
THBS3P49746 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
THBS3P49746 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
THBS3P49746 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
THBS3P49746 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
THBS3P49746 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
THBS3P49746 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
THBS3P49746 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
THBS3P49746 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
THBS3P49746 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
THBS3P49746 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
THBS3P49746 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
THBS3P49746 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
THBS3P49746 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
THBS3P49746 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
THBS3P49746 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
THBS3P49746 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
THBS3P49746 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
THBS3P49746 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
THBS3P49746 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
THBS3P49746 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
THBS3P49746 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
THBS3P49746 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
THBS3P49746 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
THBS3P49746 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
THBS3P49746 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
THBS3P49746 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
THBS3P49746 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
THBS3P49746 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
THBS3P49746 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
THBS3P49746 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms