Protein–RNA interactions for Protein: P48788

TNNI2, Troponin I, fast skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI2P48788 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
TNNI2P48788 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
TNNI2P48788 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
TNNI2P48788 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
TNNI2P48788 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
TNNI2P48788 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
TNNI2P48788 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC33.53■■■□□ 2.96
TNNI2P48788 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
TNNI2P48788 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
TNNI2P48788 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
TNNI2P48788 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
TNNI2P48788 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
TNNI2P48788 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
TNNI2P48788 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
TNNI2P48788 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
TNNI2P48788 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC33.41■■■□□ 2.94
TNNI2P48788 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
TNNI2P48788 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
TNNI2P48788 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
TNNI2P48788 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
TNNI2P48788 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
TNNI2P48788 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC33.38■■■□□ 2.93
TNNI2P48788 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
TNNI2P48788 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
TNNI2P48788 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC33.36■■■□□ 2.93
TNNI2P48788 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
TNNI2P48788 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
TNNI2P48788 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
TNNI2P48788 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
TNNI2P48788 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
TNNI2P48788 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.33■■■□□ 2.93
TNNI2P48788 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
TNNI2P48788 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC33.31■■■□□ 2.92
TNNI2P48788 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
TNNI2P48788 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
TNNI2P48788 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
TNNI2P48788 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC33.29■■■□□ 2.92
TNNI2P48788 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
TNNI2P48788 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
TNNI2P48788 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
TNNI2P48788 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
TNNI2P48788 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
TNNI2P48788 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
TNNI2P48788 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
TNNI2P48788 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
TNNI2P48788 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
TNNI2P48788 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
TNNI2P48788 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
TNNI2P48788 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
TNNI2P48788 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
TNNI2P48788 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
TNNI2P48788 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
TNNI2P48788 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
TNNI2P48788 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
TNNI2P48788 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
TNNI2P48788 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
TNNI2P48788 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
TNNI2P48788 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
TNNI2P48788 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
TNNI2P48788 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
TNNI2P48788 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
TNNI2P48788 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
TNNI2P48788 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC33.08■■■□□ 2.89
TNNI2P48788 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
TNNI2P48788 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
TNNI2P48788 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC33.05■■■□□ 2.88
TNNI2P48788 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
TNNI2P48788 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
TNNI2P48788 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
TNNI2P48788 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
TNNI2P48788 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
TNNI2P48788 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC33.01■■■□□ 2.87
TNNI2P48788 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
TNNI2P48788 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
TNNI2P48788 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
TNNI2P48788 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC32.98■■■□□ 2.87
TNNI2P48788 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
TNNI2P48788 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
TNNI2P48788 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC32.95■■■□□ 2.87
TNNI2P48788 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
TNNI2P48788 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
TNNI2P48788 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC32.93■■■□□ 2.86
TNNI2P48788 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
TNNI2P48788 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
TNNI2P48788 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
TNNI2P48788 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
TNNI2P48788 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC32.89■■■□□ 2.86
TNNI2P48788 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
TNNI2P48788 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
TNNI2P48788 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
TNNI2P48788 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
TNNI2P48788 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
TNNI2P48788 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
TNNI2P48788 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
TNNI2P48788 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
TNNI2P48788 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
TNNI2P48788 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC32.78■■■□□ 2.84
TNNI2P48788 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
TNNI2P48788 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
TNNI2P48788 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms