Protein–RNA interactions for Protein: P48444

ARCN1, Coatomer subunit delta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARCN1P48444 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ARCN1P48444 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ARCN1P48444 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ARCN1P48444 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ARCN1P48444 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ARCN1P48444 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ARCN1P48444 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ARCN1P48444 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ARCN1P48444 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ARCN1P48444 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ARCN1P48444 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ARCN1P48444 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ARCN1P48444 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ARCN1P48444 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ARCN1P48444 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ARCN1P48444 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ARCN1P48444 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ARCN1P48444 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ARCN1P48444 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ARCN1P48444 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ARCN1P48444 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ARCN1P48444 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ARCN1P48444 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ARCN1P48444 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ARCN1P48444 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
ARCN1P48444 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ARCN1P48444 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ARCN1P48444 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ARCN1P48444 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ARCN1P48444 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ARCN1P48444 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
ARCN1P48444 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ARCN1P48444 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ARCN1P48444 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ARCN1P48444 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ARCN1P48444 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ARCN1P48444 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ARCN1P48444 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ARCN1P48444 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ARCN1P48444 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ARCN1P48444 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ARCN1P48444 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ARCN1P48444 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ARCN1P48444 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ARCN1P48444 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ARCN1P48444 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ARCN1P48444 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ARCN1P48444 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ARCN1P48444 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ARCN1P48444 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ARCN1P48444 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ARCN1P48444 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ARCN1P48444 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ARCN1P48444 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ARCN1P48444 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ARCN1P48444 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ARCN1P48444 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
ARCN1P48444 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
ARCN1P48444 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
ARCN1P48444 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ARCN1P48444 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ARCN1P48444 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ARCN1P48444 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ARCN1P48444 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ARCN1P48444 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
ARCN1P48444 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ARCN1P48444 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
ARCN1P48444 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ARCN1P48444 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
ARCN1P48444 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
ARCN1P48444 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ARCN1P48444 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ARCN1P48444 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ARCN1P48444 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ARCN1P48444 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ARCN1P48444 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ARCN1P48444 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ARCN1P48444 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ARCN1P48444 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ARCN1P48444 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ARCN1P48444 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ARCN1P48444 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ARCN1P48444 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ARCN1P48444 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ARCN1P48444 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ARCN1P48444 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ARCN1P48444 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ARCN1P48444 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ARCN1P48444 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ARCN1P48444 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
ARCN1P48444 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
ARCN1P48444 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ARCN1P48444 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ARCN1P48444 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ARCN1P48444 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ARCN1P48444 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ARCN1P48444 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ARCN1P48444 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ARCN1P48444 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ARCN1P48444 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.5 ms