Protein–RNA interactions for Protein: P47895

ALDH1A3, Aldehyde dehydrogenase family 1 member A3, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH1A3P47895 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ALDH1A3P47895 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ALDH1A3P47895 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
ALDH1A3P47895 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
ALDH1A3P47895 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
ALDH1A3P47895 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
ALDH1A3P47895 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ALDH1A3P47895 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ALDH1A3P47895 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
ALDH1A3P47895 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ALDH1A3P47895 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
ALDH1A3P47895 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
ALDH1A3P47895 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
ALDH1A3P47895 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
ALDH1A3P47895 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ALDH1A3P47895 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ALDH1A3P47895 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
ALDH1A3P47895 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ALDH1A3P47895 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
ALDH1A3P47895 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ALDH1A3P47895 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
ALDH1A3P47895 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
ALDH1A3P47895 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ALDH1A3P47895 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
ALDH1A3P47895 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ALDH1A3P47895 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ALDH1A3P47895 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ALDH1A3P47895 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ALDH1A3P47895 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ALDH1A3P47895 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ALDH1A3P47895 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
ALDH1A3P47895 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ALDH1A3P47895 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ALDH1A3P47895 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ALDH1A3P47895 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
ALDH1A3P47895 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
ALDH1A3P47895 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ALDH1A3P47895 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ALDH1A3P47895 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ALDH1A3P47895 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ALDH1A3P47895 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
ALDH1A3P47895 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ALDH1A3P47895 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
ALDH1A3P47895 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ALDH1A3P47895 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ALDH1A3P47895 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ALDH1A3P47895 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
ALDH1A3P47895 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ALDH1A3P47895 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ALDH1A3P47895 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ALDH1A3P47895 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ALDH1A3P47895 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ALDH1A3P47895 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
ALDH1A3P47895 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ALDH1A3P47895 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ALDH1A3P47895 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
ALDH1A3P47895 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ALDH1A3P47895 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ALDH1A3P47895 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
ALDH1A3P47895 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ALDH1A3P47895 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ALDH1A3P47895 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ALDH1A3P47895 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
ALDH1A3P47895 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ALDH1A3P47895 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ALDH1A3P47895 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ALDH1A3P47895 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ALDH1A3P47895 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ALDH1A3P47895 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ALDH1A3P47895 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ALDH1A3P47895 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ALDH1A3P47895 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ALDH1A3P47895 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ALDH1A3P47895 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ALDH1A3P47895 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ALDH1A3P47895 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ALDH1A3P47895 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ALDH1A3P47895 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
ALDH1A3P47895 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ALDH1A3P47895 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ALDH1A3P47895 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ALDH1A3P47895 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ALDH1A3P47895 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ALDH1A3P47895 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ALDH1A3P47895 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ALDH1A3P47895 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ALDH1A3P47895 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
ALDH1A3P47895 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ALDH1A3P47895 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ALDH1A3P47895 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
ALDH1A3P47895 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ALDH1A3P47895 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ALDH1A3P47895 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ALDH1A3P47895 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ALDH1A3P47895 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ALDH1A3P47895 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ALDH1A3P47895 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
ALDH1A3P47895 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ALDH1A3P47895 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ALDH1A3P47895 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms