Protein–RNA interactions for Protein: P43146

DCC, Netrin receptor DCC, humanhuman

Predictions only

Length 1,447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCCP43146 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC39.8■■■■□ 3.96
DCCP43146 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC39.78■■■■□ 3.96
DCCP43146 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC39.76■■■■□ 3.96
DCCP43146 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.76■■■■□ 3.95
DCCP43146 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC39.74■■■■□ 3.95
DCCP43146 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.74■■■■□ 3.95
DCCP43146 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC39.73■■■■□ 3.95
DCCP43146 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
DCCP43146 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
DCCP43146 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.7■■■■□ 3.95
DCCP43146 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC39.66■■■■□ 3.94
DCCP43146 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC39.65■■■■□ 3.94
DCCP43146 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC39.65■■■■□ 3.94
DCCP43146 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
DCCP43146 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC39.64■■■■□ 3.94
DCCP43146 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.62■■■■□ 3.93
DCCP43146 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.61■■■■□ 3.93
DCCP43146 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC39.6■■■■□ 3.93
DCCP43146 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC39.6■■■■□ 3.93
DCCP43146 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.93
DCCP43146 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC39.57■■■■□ 3.93
DCCP43146 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
DCCP43146 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
DCCP43146 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.51■■■■□ 3.92
DCCP43146 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC39.51■■■■□ 3.92
DCCP43146 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
DCCP43146 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC39.47■■■■□ 3.91
DCCP43146 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC39.47■■■■□ 3.91
DCCP43146 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.45■■■■□ 3.91
DCCP43146 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC39.42■■■■□ 3.9
DCCP43146 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC39.42■■■■□ 3.9
DCCP43146 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC39.41■■■■□ 3.9
DCCP43146 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC39.4■■■■□ 3.9
DCCP43146 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC39.4■■■■□ 3.9
DCCP43146 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC39.36■■■■□ 3.89
DCCP43146 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC39.35■■■■□ 3.89
DCCP43146 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
DCCP43146 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
DCCP43146 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
DCCP43146 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.33■■■■□ 3.89
DCCP43146 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC39.32■■■■□ 3.89
DCCP43146 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC39.29■■■■□ 3.88
DCCP43146 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
DCCP43146 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC39.28■■■■□ 3.88
DCCP43146 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC39.28■■■■□ 3.88
DCCP43146 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC39.24■■■■□ 3.87
DCCP43146 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC39.23■■■■□ 3.87
DCCP43146 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
DCCP43146 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC39.23■■■■□ 3.87
DCCP43146 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.22■■■■□ 3.87
DCCP43146 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.22■■■■□ 3.87
DCCP43146 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
DCCP43146 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.19■■■■□ 3.86
DCCP43146 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC39.19■■■■□ 3.86
DCCP43146 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC39.19■■■■□ 3.86
DCCP43146 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
DCCP43146 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
DCCP43146 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
DCCP43146 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
DCCP43146 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC39.09■■■■□ 3.85
DCCP43146 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC39.09■■■■□ 3.85
DCCP43146 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC39.08■■■■□ 3.85
DCCP43146 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC39.06■■■■□ 3.84
DCCP43146 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC39.06■■■■□ 3.84
DCCP43146 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC39.06■■■■□ 3.84
DCCP43146 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
DCCP43146 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC39.04■■■■□ 3.84
DCCP43146 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
DCCP43146 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC39.03■■■■□ 3.84
DCCP43146 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC39.01■■■■□ 3.84
DCCP43146 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
DCCP43146 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
DCCP43146 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
DCCP43146 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38.98■■■■□ 3.83
DCCP43146 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC38.97■■■■□ 3.83
DCCP43146 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC38.95■■■■□ 3.83
DCCP43146 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
DCCP43146 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
DCCP43146 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
DCCP43146 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC38.91■■■■□ 3.82
DCCP43146 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.9■■■■□ 3.82
DCCP43146 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC38.89■■■■□ 3.82
DCCP43146 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
DCCP43146 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC38.84■■■■□ 3.81
DCCP43146 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
DCCP43146 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC38.82■■■■□ 3.81
DCCP43146 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
DCCP43146 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
DCCP43146 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.79■■■■□ 3.8
DCCP43146 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
DCCP43146 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
DCCP43146 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
DCCP43146 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
DCCP43146 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.75■■■■□ 3.79
DCCP43146 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC38.73■■■■□ 3.79
DCCP43146 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
DCCP43146 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC38.71■■■■□ 3.79
DCCP43146 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC38.68■■■■□ 3.78
DCCP43146 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
DCCP43146 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms