Protein–RNA interactions for Protein: P42898

MTHFR, Methylenetetrahydrofolate reductase, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFRP42898 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
MTHFRP42898 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
MTHFRP42898 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
MTHFRP42898 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
MTHFRP42898 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
MTHFRP42898 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
MTHFRP42898 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
MTHFRP42898 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
MTHFRP42898 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
MTHFRP42898 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
MTHFRP42898 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC29.58■■■□□ 2.33
MTHFRP42898 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
MTHFRP42898 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
MTHFRP42898 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
MTHFRP42898 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
MTHFRP42898 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
MTHFRP42898 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
MTHFRP42898 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
MTHFRP42898 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
MTHFRP42898 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
MTHFRP42898 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
MTHFRP42898 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
MTHFRP42898 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
MTHFRP42898 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
MTHFRP42898 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
MTHFRP42898 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
MTHFRP42898 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
MTHFRP42898 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
MTHFRP42898 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
MTHFRP42898 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
MTHFRP42898 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
MTHFRP42898 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
MTHFRP42898 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
MTHFRP42898 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
MTHFRP42898 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
MTHFRP42898 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
MTHFRP42898 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
MTHFRP42898 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
MTHFRP42898 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
MTHFRP42898 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
MTHFRP42898 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
MTHFRP42898 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
MTHFRP42898 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
MTHFRP42898 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
MTHFRP42898 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
MTHFRP42898 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
MTHFRP42898 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
MTHFRP42898 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
MTHFRP42898 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
MTHFRP42898 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
MTHFRP42898 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
MTHFRP42898 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
MTHFRP42898 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
MTHFRP42898 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
MTHFRP42898 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
MTHFRP42898 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
MTHFRP42898 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
MTHFRP42898 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
MTHFRP42898 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
MTHFRP42898 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
MTHFRP42898 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
MTHFRP42898 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
MTHFRP42898 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
MTHFRP42898 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
MTHFRP42898 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
MTHFRP42898 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
MTHFRP42898 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
MTHFRP42898 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
MTHFRP42898 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
MTHFRP42898 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
MTHFRP42898 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
MTHFRP42898 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
MTHFRP42898 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
MTHFRP42898 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
MTHFRP42898 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
MTHFRP42898 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
MTHFRP42898 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
MTHFRP42898 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
MTHFRP42898 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
MTHFRP42898 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
MTHFRP42898 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
MTHFRP42898 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
MTHFRP42898 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
MTHFRP42898 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
MTHFRP42898 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
MTHFRP42898 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
MTHFRP42898 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
MTHFRP42898 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
MTHFRP42898 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
MTHFRP42898 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
MTHFRP42898 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
MTHFRP42898 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
MTHFRP42898 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
MTHFRP42898 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
MTHFRP42898 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
MTHFRP42898 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
MTHFRP42898 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
MTHFRP42898 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
MTHFRP42898 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
MTHFRP42898 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9 ms