Protein–RNA interactions for Protein: P42336

PIK3CA, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CAP42336 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PIK3CAP42336 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
PIK3CAP42336 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC30.03■■■□□ 2.4
PIK3CAP42336 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PIK3CAP42336 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
PIK3CAP42336 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PIK3CAP42336 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PIK3CAP42336 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PIK3CAP42336 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PIK3CAP42336 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PIK3CAP42336 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
PIK3CAP42336 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PIK3CAP42336 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PIK3CAP42336 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PIK3CAP42336 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
PIK3CAP42336 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
PIK3CAP42336 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
PIK3CAP42336 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
PIK3CAP42336 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PIK3CAP42336 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PIK3CAP42336 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PIK3CAP42336 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PIK3CAP42336 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PIK3CAP42336 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PIK3CAP42336 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
PIK3CAP42336 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PIK3CAP42336 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PIK3CAP42336 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PIK3CAP42336 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PIK3CAP42336 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PIK3CAP42336 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PIK3CAP42336 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
PIK3CAP42336 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PIK3CAP42336 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PIK3CAP42336 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PIK3CAP42336 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PIK3CAP42336 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.36
PIK3CAP42336 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PIK3CAP42336 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
PIK3CAP42336 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PIK3CAP42336 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
PIK3CAP42336 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
PIK3CAP42336 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
PIK3CAP42336 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PIK3CAP42336 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PIK3CAP42336 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PIK3CAP42336 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
PIK3CAP42336 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
PIK3CAP42336 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PIK3CAP42336 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PIK3CAP42336 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PIK3CAP42336 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PIK3CAP42336 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC29.63■■■□□ 2.33
PIK3CAP42336 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PIK3CAP42336 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PIK3CAP42336 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PIK3CAP42336 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PIK3CAP42336 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
PIK3CAP42336 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PIK3CAP42336 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PIK3CAP42336 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PIK3CAP42336 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PIK3CAP42336 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PIK3CAP42336 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PIK3CAP42336 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PIK3CAP42336 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PIK3CAP42336 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PIK3CAP42336 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PIK3CAP42336 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PIK3CAP42336 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PIK3CAP42336 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PIK3CAP42336 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PIK3CAP42336 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
PIK3CAP42336 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PIK3CAP42336 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PIK3CAP42336 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PIK3CAP42336 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PIK3CAP42336 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PIK3CAP42336 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PIK3CAP42336 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PIK3CAP42336 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
PIK3CAP42336 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PIK3CAP42336 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PIK3CAP42336 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.3
PIK3CAP42336 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PIK3CAP42336 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PIK3CAP42336 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PIK3CAP42336 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PIK3CAP42336 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PIK3CAP42336 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PIK3CAP42336 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PIK3CAP42336 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PIK3CAP42336 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PIK3CAP42336 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PIK3CAP42336 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PIK3CAP42336 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PIK3CAP42336 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PIK3CAP42336 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PIK3CAP42336 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PIK3CAP42336 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.9 ms