Protein–RNA interactions for Protein: P40306

PSMB10, Proteasome subunit beta type-10, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB10P40306 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PSMB10P40306 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PSMB10P40306 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PSMB10P40306 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PSMB10P40306 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PSMB10P40306 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PSMB10P40306 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PSMB10P40306 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PSMB10P40306 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PSMB10P40306 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PSMB10P40306 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PSMB10P40306 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PSMB10P40306 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PSMB10P40306 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PSMB10P40306 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PSMB10P40306 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PSMB10P40306 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PSMB10P40306 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PSMB10P40306 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PSMB10P40306 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PSMB10P40306 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PSMB10P40306 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PSMB10P40306 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PSMB10P40306 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PSMB10P40306 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PSMB10P40306 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PSMB10P40306 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PSMB10P40306 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PSMB10P40306 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PSMB10P40306 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PSMB10P40306 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PSMB10P40306 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PSMB10P40306 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PSMB10P40306 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PSMB10P40306 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PSMB10P40306 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PSMB10P40306 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PSMB10P40306 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PSMB10P40306 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PSMB10P40306 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PSMB10P40306 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PSMB10P40306 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PSMB10P40306 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PSMB10P40306 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PSMB10P40306 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PSMB10P40306 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PSMB10P40306 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PSMB10P40306 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PSMB10P40306 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PSMB10P40306 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PSMB10P40306 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PSMB10P40306 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PSMB10P40306 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PSMB10P40306 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PSMB10P40306 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PSMB10P40306 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PSMB10P40306 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PSMB10P40306 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PSMB10P40306 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PSMB10P40306 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PSMB10P40306 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PSMB10P40306 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PSMB10P40306 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PSMB10P40306 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PSMB10P40306 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PSMB10P40306 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PSMB10P40306 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSMB10P40306 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSMB10P40306 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PSMB10P40306 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PSMB10P40306 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PSMB10P40306 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PSMB10P40306 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PSMB10P40306 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PSMB10P40306 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PSMB10P40306 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PSMB10P40306 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PSMB10P40306 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PSMB10P40306 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PSMB10P40306 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PSMB10P40306 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PSMB10P40306 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PSMB10P40306 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PSMB10P40306 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PSMB10P40306 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PSMB10P40306 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PSMB10P40306 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PSMB10P40306 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PSMB10P40306 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PSMB10P40306 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PSMB10P40306 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PSMB10P40306 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PSMB10P40306 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PSMB10P40306 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PSMB10P40306 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PSMB10P40306 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PSMB10P40306 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PSMB10P40306 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PSMB10P40306 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PSMB10P40306 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms