Protein–RNA interactions for Protein: P39748

FEN1, Flap endonuclease 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FEN1P39748 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
FEN1P39748 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
FEN1P39748 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
FEN1P39748 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
FEN1P39748 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
FEN1P39748 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
FEN1P39748 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
FEN1P39748 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
FEN1P39748 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
FEN1P39748 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FEN1P39748 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
FEN1P39748 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
FEN1P39748 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FEN1P39748 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FEN1P39748 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
FEN1P39748 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
FEN1P39748 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FEN1P39748 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
FEN1P39748 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FEN1P39748 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
FEN1P39748 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
FEN1P39748 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
FEN1P39748 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
FEN1P39748 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FEN1P39748 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
FEN1P39748 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
FEN1P39748 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
FEN1P39748 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
FEN1P39748 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FEN1P39748 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FEN1P39748 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FEN1P39748 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
FEN1P39748 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
FEN1P39748 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
FEN1P39748 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FEN1P39748 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FEN1P39748 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
FEN1P39748 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
FEN1P39748 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FEN1P39748 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
FEN1P39748 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FEN1P39748 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FEN1P39748 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FEN1P39748 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
FEN1P39748 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
FEN1P39748 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FEN1P39748 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
FEN1P39748 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
FEN1P39748 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
FEN1P39748 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
FEN1P39748 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
FEN1P39748 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
FEN1P39748 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
FEN1P39748 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
FEN1P39748 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
FEN1P39748 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
FEN1P39748 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
FEN1P39748 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
FEN1P39748 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
FEN1P39748 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
FEN1P39748 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
FEN1P39748 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
FEN1P39748 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
FEN1P39748 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
FEN1P39748 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
FEN1P39748 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FEN1P39748 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FEN1P39748 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
FEN1P39748 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
FEN1P39748 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FEN1P39748 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
FEN1P39748 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FEN1P39748 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FEN1P39748 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
FEN1P39748 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
FEN1P39748 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
FEN1P39748 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FEN1P39748 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
FEN1P39748 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FEN1P39748 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FEN1P39748 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
FEN1P39748 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
FEN1P39748 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
FEN1P39748 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
FEN1P39748 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
FEN1P39748 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
FEN1P39748 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FEN1P39748 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
FEN1P39748 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
FEN1P39748 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
FEN1P39748 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FEN1P39748 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FEN1P39748 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
FEN1P39748 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
FEN1P39748 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
FEN1P39748 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FEN1P39748 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FEN1P39748 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FEN1P39748 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FEN1P39748 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms