Protein–RNA interactions for Protein: P35542

SAA4, Serum amyloid A-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAA4P35542 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SAA4P35542 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SAA4P35542 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SAA4P35542 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SAA4P35542 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SAA4P35542 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SAA4P35542 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SAA4P35542 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SAA4P35542 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SAA4P35542 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SAA4P35542 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SAA4P35542 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SAA4P35542 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SAA4P35542 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SAA4P35542 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SAA4P35542 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SAA4P35542 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SAA4P35542 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SAA4P35542 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SAA4P35542 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SAA4P35542 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SAA4P35542 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SAA4P35542 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SAA4P35542 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SAA4P35542 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SAA4P35542 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SAA4P35542 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SAA4P35542 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SAA4P35542 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SAA4P35542 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SAA4P35542 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SAA4P35542 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SAA4P35542 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SAA4P35542 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SAA4P35542 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SAA4P35542 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SAA4P35542 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SAA4P35542 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SAA4P35542 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SAA4P35542 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SAA4P35542 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SAA4P35542 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SAA4P35542 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SAA4P35542 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SAA4P35542 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SAA4P35542 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SAA4P35542 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SAA4P35542 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SAA4P35542 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SAA4P35542 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SAA4P35542 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SAA4P35542 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SAA4P35542 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SAA4P35542 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SAA4P35542 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SAA4P35542 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SAA4P35542 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SAA4P35542 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SAA4P35542 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SAA4P35542 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SAA4P35542 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SAA4P35542 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SAA4P35542 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SAA4P35542 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SAA4P35542 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SAA4P35542 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SAA4P35542 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SAA4P35542 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SAA4P35542 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SAA4P35542 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SAA4P35542 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SAA4P35542 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SAA4P35542 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SAA4P35542 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SAA4P35542 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SAA4P35542 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SAA4P35542 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SAA4P35542 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SAA4P35542 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SAA4P35542 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SAA4P35542 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SAA4P35542 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SAA4P35542 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SAA4P35542 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SAA4P35542 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SAA4P35542 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SAA4P35542 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SAA4P35542 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SAA4P35542 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SAA4P35542 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SAA4P35542 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SAA4P35542 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SAA4P35542 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SAA4P35542 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SAA4P35542 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SAA4P35542 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SAA4P35542 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SAA4P35542 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SAA4P35542 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SAA4P35542 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms