Protein–RNA interactions for Protein: P35408

PTGER4, Prostaglandin E2 receptor EP4 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER4P35408 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTGER4P35408 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTGER4P35408 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PTGER4P35408 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTGER4P35408 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTGER4P35408 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTGER4P35408 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTGER4P35408 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTGER4P35408 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTGER4P35408 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTGER4P35408 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTGER4P35408 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTGER4P35408 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PTGER4P35408 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTGER4P35408 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTGER4P35408 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTGER4P35408 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTGER4P35408 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTGER4P35408 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PTGER4P35408 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTGER4P35408 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTGER4P35408 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PTGER4P35408 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTGER4P35408 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTGER4P35408 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTGER4P35408 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTGER4P35408 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTGER4P35408 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTGER4P35408 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTGER4P35408 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTGER4P35408 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTGER4P35408 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTGER4P35408 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PTGER4P35408 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTGER4P35408 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTGER4P35408 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTGER4P35408 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTGER4P35408 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTGER4P35408 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTGER4P35408 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTGER4P35408 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTGER4P35408 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTGER4P35408 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTGER4P35408 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTGER4P35408 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTGER4P35408 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PTGER4P35408 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTGER4P35408 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTGER4P35408 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PTGER4P35408 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTGER4P35408 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTGER4P35408 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTGER4P35408 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTGER4P35408 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTGER4P35408 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PTGER4P35408 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTGER4P35408 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTGER4P35408 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTGER4P35408 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTGER4P35408 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTGER4P35408 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTGER4P35408 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PTGER4P35408 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTGER4P35408 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PTGER4P35408 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTGER4P35408 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTGER4P35408 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTGER4P35408 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTGER4P35408 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTGER4P35408 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTGER4P35408 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTGER4P35408 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTGER4P35408 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTGER4P35408 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PTGER4P35408 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTGER4P35408 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTGER4P35408 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTGER4P35408 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTGER4P35408 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTGER4P35408 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTGER4P35408 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTGER4P35408 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTGER4P35408 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PTGER4P35408 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTGER4P35408 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTGER4P35408 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTGER4P35408 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTGER4P35408 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTGER4P35408 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTGER4P35408 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTGER4P35408 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTGER4P35408 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTGER4P35408 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTGER4P35408 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTGER4P35408 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTGER4P35408 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTGER4P35408 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTGER4P35408 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PTGER4P35408 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTGER4P35408 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms