Protein–RNA interactions for Protein: P34059

GALNS, N-acetylgalactosamine-6-sulfatase, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GALNSP34059 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GALNSP34059 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GALNSP34059 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GALNSP34059 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GALNSP34059 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GALNSP34059 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GALNSP34059 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GALNSP34059 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GALNSP34059 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GALNSP34059 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GALNSP34059 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GALNSP34059 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GALNSP34059 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
GALNSP34059 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
GALNSP34059 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
GALNSP34059 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GALNSP34059 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GALNSP34059 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GALNSP34059 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GALNSP34059 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GALNSP34059 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GALNSP34059 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GALNSP34059 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GALNSP34059 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GALNSP34059 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GALNSP34059 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GALNSP34059 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GALNSP34059 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GALNSP34059 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GALNSP34059 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GALNSP34059 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GALNSP34059 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
GALNSP34059 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GALNSP34059 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GALNSP34059 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
GALNSP34059 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GALNSP34059 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GALNSP34059 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GALNSP34059 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
GALNSP34059 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GALNSP34059 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GALNSP34059 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GALNSP34059 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GALNSP34059 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GALNSP34059 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GALNSP34059 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GALNSP34059 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
GALNSP34059 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GALNSP34059 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
GALNSP34059 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GALNSP34059 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GALNSP34059 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GALNSP34059 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
GALNSP34059 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
GALNSP34059 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GALNSP34059 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GALNSP34059 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GALNSP34059 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GALNSP34059 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GALNSP34059 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GALNSP34059 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GALNSP34059 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GALNSP34059 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GALNSP34059 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GALNSP34059 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GALNSP34059 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GALNSP34059 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.68
GALNSP34059 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GALNSP34059 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GALNSP34059 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GALNSP34059 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GALNSP34059 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GALNSP34059 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GALNSP34059 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GALNSP34059 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GALNSP34059 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GALNSP34059 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
GALNSP34059 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
GALNSP34059 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GALNSP34059 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GALNSP34059 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GALNSP34059 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GALNSP34059 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GALNSP34059 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GALNSP34059 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GALNSP34059 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GALNSP34059 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GALNSP34059 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GALNSP34059 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GALNSP34059 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GALNSP34059 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
GALNSP34059 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GALNSP34059 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GALNSP34059 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GALNSP34059 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GALNSP34059 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GALNSP34059 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GALNSP34059 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GALNSP34059 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GALNSP34059 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.8 ms