Protein–RNA interactions for Protein: P33764

S100A3, Protein S100-A3, humanhuman

Predictions only

Length 101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
S100A3P33764 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
S100A3P33764 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
S100A3P33764 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
S100A3P33764 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
S100A3P33764 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
S100A3P33764 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
S100A3P33764 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
S100A3P33764 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
S100A3P33764 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
S100A3P33764 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
S100A3P33764 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
S100A3P33764 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
S100A3P33764 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
S100A3P33764 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
S100A3P33764 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
S100A3P33764 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
S100A3P33764 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
S100A3P33764 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
S100A3P33764 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
S100A3P33764 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
S100A3P33764 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
S100A3P33764 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
S100A3P33764 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
S100A3P33764 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
S100A3P33764 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
S100A3P33764 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
S100A3P33764 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
S100A3P33764 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
S100A3P33764 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
S100A3P33764 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
S100A3P33764 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
S100A3P33764 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
S100A3P33764 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
S100A3P33764 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
S100A3P33764 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
S100A3P33764 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
S100A3P33764 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
S100A3P33764 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
S100A3P33764 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
S100A3P33764 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
S100A3P33764 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
S100A3P33764 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
S100A3P33764 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
S100A3P33764 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
S100A3P33764 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
S100A3P33764 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
S100A3P33764 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
S100A3P33764 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
S100A3P33764 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
S100A3P33764 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
S100A3P33764 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
S100A3P33764 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
S100A3P33764 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
S100A3P33764 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
S100A3P33764 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
S100A3P33764 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
S100A3P33764 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
S100A3P33764 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
S100A3P33764 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
S100A3P33764 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
S100A3P33764 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
S100A3P33764 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
S100A3P33764 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
S100A3P33764 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
S100A3P33764 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
S100A3P33764 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
S100A3P33764 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
S100A3P33764 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
S100A3P33764 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
S100A3P33764 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
S100A3P33764 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
S100A3P33764 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
S100A3P33764 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
S100A3P33764 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26■■□□□ 1.75
S100A3P33764 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
S100A3P33764 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
S100A3P33764 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
S100A3P33764 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
S100A3P33764 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
S100A3P33764 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
S100A3P33764 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
S100A3P33764 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
S100A3P33764 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
S100A3P33764 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
S100A3P33764 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
S100A3P33764 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
S100A3P33764 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
S100A3P33764 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
S100A3P33764 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
S100A3P33764 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
S100A3P33764 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
S100A3P33764 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
S100A3P33764 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
S100A3P33764 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
S100A3P33764 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
S100A3P33764 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
S100A3P33764 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
S100A3P33764 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
S100A3P33764 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
S100A3P33764 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms