Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC42.81■■■■■ 4.44
PTPRMP28827 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC42.76■■■■■ 4.44
PTPRMP28827 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC42.75■■■■■ 4.43
PTPRMP28827 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC42.71■■■■■ 4.43
PTPRMP28827 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC42.69■■■■■ 4.42
PTPRMP28827 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC42.68■■■■■ 4.42
PTPRMP28827 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC42.68■■■■■ 4.42
PTPRMP28827 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.68■■■■■ 4.42
PTPRMP28827 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC42.67■■■■■ 4.42
PTPRMP28827 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC42.66■■■■■ 4.42
PTPRMP28827 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.65■■■■■ 4.42
PTPRMP28827 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC42.64■■■■■ 4.42
PTPRMP28827 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC42.62■■■■■ 4.41
PTPRMP28827 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC42.6■■■■■ 4.41
PTPRMP28827 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC42.6■■■■■ 4.41
PTPRMP28827 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.58■■■■■ 4.41
PTPRMP28827 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC42.57■■■■■ 4.41
PTPRMP28827 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC42.55■■■■■ 4.4
PTPRMP28827 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC42.55■■■■■ 4.4
PTPRMP28827 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC42.54■■■■■ 4.4
PTPRMP28827 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC42.52■■■■■ 4.4
PTPRMP28827 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.5■■■■■ 4.39
PTPRMP28827 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.49■■■■■ 4.39
PTPRMP28827 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC42.49■■■■■ 4.39
PTPRMP28827 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.45■■■■■ 4.39
PTPRMP28827 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC42.44■■■■■ 4.38
PTPRMP28827 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC42.42■■■■■ 4.38
PTPRMP28827 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC42.42■■■■■ 4.38
PTPRMP28827 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.41■■■■■ 4.38
PTPRMP28827 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.39■■■■■ 4.38
PTPRMP28827 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.39■■■■■ 4.38
PTPRMP28827 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC42.38■■■■■ 4.38
PTPRMP28827 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC42.38■■■■■ 4.38
PTPRMP28827 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC42.37■■■■■ 4.37
PTPRMP28827 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC42.37■■■■■ 4.37
PTPRMP28827 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC42.34■■■■■ 4.37
PTPRMP28827 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.33■■■■■ 4.37
PTPRMP28827 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC42.3■■■■■ 4.36
PTPRMP28827 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.25■■■■■ 4.35
PTPRMP28827 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.25■■■■■ 4.35
PTPRMP28827 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.22■■■■■ 4.35
PTPRMP28827 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC42.22■■■■■ 4.35
PTPRMP28827 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC42.21■■■■■ 4.35
PTPRMP28827 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC42.18■■■■■ 4.34
PTPRMP28827 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.18■■■■■ 4.34
PTPRMP28827 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC42.16■■■■■ 4.34
PTPRMP28827 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC42.16■■■■■ 4.34
PTPRMP28827 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC42.15■■■■■ 4.34
PTPRMP28827 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC42.14■■■■■ 4.34
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PTPRMP28827 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.12■■■■■ 4.33
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PTPRMP28827 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.09■■■■■ 4.33
PTPRMP28827 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC42.08■■■■■ 4.33
PTPRMP28827 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC42.07■■■■■ 4.33
PTPRMP28827 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.07■■■■■ 4.33
PTPRMP28827 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.07■■■■■ 4.33
PTPRMP28827 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC42.07■■■■■ 4.32
PTPRMP28827 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC42.06■■■■■ 4.32
PTPRMP28827 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC42.05■■■■■ 4.32
PTPRMP28827 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.04■■■■■ 4.32
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PTPRMP28827 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC42.04■■■■■ 4.32
PTPRMP28827 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC42.04■■■■■ 4.32
PTPRMP28827 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC41.98■■■■■ 4.31
PTPRMP28827 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.97■■■■■ 4.31
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PTPRMP28827 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC41.92■■■■■ 4.3
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PTPRMP28827 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC41.89■■■■■ 4.3
PTPRMP28827 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.88■■■■■ 4.29
PTPRMP28827 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC41.88■■■■■ 4.29
PTPRMP28827 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41.86■■■■■ 4.29
PTPRMP28827 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC41.85■■■■■ 4.29
PTPRMP28827 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC41.84■■■■■ 4.29
PTPRMP28827 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC41.83■■■■■ 4.29
PTPRMP28827 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.79■■■■■ 4.28
PTPRMP28827 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC41.78■■■■■ 4.28
PTPRMP28827 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC41.77■■■■■ 4.28
PTPRMP28827 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC41.76■■■■■ 4.28
PTPRMP28827 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.75■■■■■ 4.27
PTPRMP28827 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC41.72■■■■■ 4.27
PTPRMP28827 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.72■■■■■ 4.27
PTPRMP28827 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.71■■■■■ 4.27
PTPRMP28827 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC41.7■■■■■ 4.27
PTPRMP28827 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.69■■■■■ 4.26
PTPRMP28827 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC41.68■■■■■ 4.26
PTPRMP28827 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.66■■■■■ 4.26
PTPRMP28827 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.65■■■■■ 4.26
PTPRMP28827 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC41.65■■■■■ 4.26
PTPRMP28827 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.64■■■■■ 4.26
PTPRMP28827 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.61■■■■■ 4.25
PTPRMP28827 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC41.6■■■■■ 4.25
PTPRMP28827 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC41.57■■■■■ 4.25
PTPRMP28827 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.54■■■■■ 4.24
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