Protein–RNA interactions for Protein: P28562

DUSP1, Dual specificity protein phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP1P28562 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DUSP1P28562 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DUSP1P28562 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
DUSP1P28562 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DUSP1P28562 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DUSP1P28562 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DUSP1P28562 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DUSP1P28562 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DUSP1P28562 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DUSP1P28562 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DUSP1P28562 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DUSP1P28562 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DUSP1P28562 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DUSP1P28562 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DUSP1P28562 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DUSP1P28562 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DUSP1P28562 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DUSP1P28562 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DUSP1P28562 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DUSP1P28562 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DUSP1P28562 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DUSP1P28562 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
DUSP1P28562 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
DUSP1P28562 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DUSP1P28562 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DUSP1P28562 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DUSP1P28562 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DUSP1P28562 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DUSP1P28562 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DUSP1P28562 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DUSP1P28562 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DUSP1P28562 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DUSP1P28562 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DUSP1P28562 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DUSP1P28562 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DUSP1P28562 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DUSP1P28562 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
DUSP1P28562 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DUSP1P28562 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DUSP1P28562 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
DUSP1P28562 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DUSP1P28562 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
DUSP1P28562 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DUSP1P28562 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DUSP1P28562 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
DUSP1P28562 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DUSP1P28562 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DUSP1P28562 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DUSP1P28562 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DUSP1P28562 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DUSP1P28562 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DUSP1P28562 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DUSP1P28562 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DUSP1P28562 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DUSP1P28562 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DUSP1P28562 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DUSP1P28562 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DUSP1P28562 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DUSP1P28562 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DUSP1P28562 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DUSP1P28562 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DUSP1P28562 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DUSP1P28562 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DUSP1P28562 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.31
DUSP1P28562 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DUSP1P28562 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DUSP1P28562 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DUSP1P28562 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DUSP1P28562 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
DUSP1P28562 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DUSP1P28562 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DUSP1P28562 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DUSP1P28562 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DUSP1P28562 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DUSP1P28562 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DUSP1P28562 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DUSP1P28562 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DUSP1P28562 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DUSP1P28562 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DUSP1P28562 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DUSP1P28562 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DUSP1P28562 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DUSP1P28562 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DUSP1P28562 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DUSP1P28562 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DUSP1P28562 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DUSP1P28562 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DUSP1P28562 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DUSP1P28562 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DUSP1P28562 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DUSP1P28562 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DUSP1P28562 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DUSP1P28562 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DUSP1P28562 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DUSP1P28562 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
DUSP1P28562 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
DUSP1P28562 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DUSP1P28562 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DUSP1P28562 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DUSP1P28562 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms