Protein–RNA interactions for Protein: P28336

NMBR, Neuromedin-B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMBRP28336 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NMBRP28336 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
NMBRP28336 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NMBRP28336 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NMBRP28336 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NMBRP28336 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NMBRP28336 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NMBRP28336 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NMBRP28336 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NMBRP28336 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NMBRP28336 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NMBRP28336 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NMBRP28336 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
NMBRP28336 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NMBRP28336 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NMBRP28336 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NMBRP28336 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NMBRP28336 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NMBRP28336 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NMBRP28336 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NMBRP28336 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NMBRP28336 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NMBRP28336 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NMBRP28336 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NMBRP28336 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NMBRP28336 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NMBRP28336 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
NMBRP28336 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
NMBRP28336 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NMBRP28336 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NMBRP28336 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NMBRP28336 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NMBRP28336 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NMBRP28336 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NMBRP28336 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NMBRP28336 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NMBRP28336 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NMBRP28336 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NMBRP28336 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NMBRP28336 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NMBRP28336 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NMBRP28336 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NMBRP28336 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NMBRP28336 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NMBRP28336 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NMBRP28336 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NMBRP28336 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NMBRP28336 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NMBRP28336 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
NMBRP28336 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NMBRP28336 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NMBRP28336 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NMBRP28336 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NMBRP28336 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
NMBRP28336 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NMBRP28336 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NMBRP28336 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NMBRP28336 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NMBRP28336 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NMBRP28336 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
NMBRP28336 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NMBRP28336 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NMBRP28336 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NMBRP28336 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NMBRP28336 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NMBRP28336 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NMBRP28336 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NMBRP28336 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NMBRP28336 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NMBRP28336 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NMBRP28336 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NMBRP28336 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NMBRP28336 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NMBRP28336 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NMBRP28336 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
NMBRP28336 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
NMBRP28336 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NMBRP28336 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NMBRP28336 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NMBRP28336 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NMBRP28336 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NMBRP28336 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NMBRP28336 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NMBRP28336 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NMBRP28336 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NMBRP28336 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NMBRP28336 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NMBRP28336 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NMBRP28336 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NMBRP28336 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NMBRP28336 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NMBRP28336 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
NMBRP28336 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
NMBRP28336 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NMBRP28336 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
NMBRP28336 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NMBRP28336 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NMBRP28336 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NMBRP28336 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
NMBRP28336 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms