Protein–RNA interactions for Protein: P24347

MMP11, Stromelysin-3, humanhuman

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP11P24347 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
MMP11P24347 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MMP11P24347 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
MMP11P24347 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
MMP11P24347 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
MMP11P24347 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
MMP11P24347 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
MMP11P24347 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MMP11P24347 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
MMP11P24347 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
MMP11P24347 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
MMP11P24347 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
MMP11P24347 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
MMP11P24347 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MMP11P24347 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
MMP11P24347 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
MMP11P24347 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
MMP11P24347 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
MMP11P24347 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
MMP11P24347 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
MMP11P24347 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
MMP11P24347 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
MMP11P24347 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
MMP11P24347 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MMP11P24347 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
MMP11P24347 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
MMP11P24347 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MMP11P24347 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MMP11P24347 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MMP11P24347 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MMP11P24347 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MMP11P24347 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MMP11P24347 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MMP11P24347 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
MMP11P24347 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MMP11P24347 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MMP11P24347 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
MMP11P24347 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
MMP11P24347 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MMP11P24347 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MMP11P24347 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MMP11P24347 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MMP11P24347 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MMP11P24347 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MMP11P24347 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MMP11P24347 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MMP11P24347 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MMP11P24347 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
MMP11P24347 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
MMP11P24347 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
MMP11P24347 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MMP11P24347 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
MMP11P24347 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MMP11P24347 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MMP11P24347 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MMP11P24347 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MMP11P24347 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MMP11P24347 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MMP11P24347 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MMP11P24347 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MMP11P24347 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MMP11P24347 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
MMP11P24347 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MMP11P24347 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
MMP11P24347 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MMP11P24347 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MMP11P24347 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MMP11P24347 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MMP11P24347 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MMP11P24347 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MMP11P24347 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MMP11P24347 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MMP11P24347 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MMP11P24347 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
MMP11P24347 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
MMP11P24347 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MMP11P24347 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MMP11P24347 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MMP11P24347 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MMP11P24347 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MMP11P24347 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MMP11P24347 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
MMP11P24347 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
MMP11P24347 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
MMP11P24347 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
MMP11P24347 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
MMP11P24347 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MMP11P24347 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MMP11P24347 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MMP11P24347 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MMP11P24347 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MMP11P24347 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MMP11P24347 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MMP11P24347 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MMP11P24347 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MMP11P24347 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MMP11P24347 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MMP11P24347 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MMP11P24347 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MMP11P24347 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms