Protein–RNA interactions for Protein: P23458

JAK1, Tyrosine-protein kinase JAK1, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JAK1P23458 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
JAK1P23458 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
JAK1P23458 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
JAK1P23458 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
JAK1P23458 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
JAK1P23458 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
JAK1P23458 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
JAK1P23458 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
JAK1P23458 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
JAK1P23458 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
JAK1P23458 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
JAK1P23458 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
JAK1P23458 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
JAK1P23458 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
JAK1P23458 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
JAK1P23458 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
JAK1P23458 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
JAK1P23458 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
JAK1P23458 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
JAK1P23458 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
JAK1P23458 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
JAK1P23458 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
JAK1P23458 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
JAK1P23458 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
JAK1P23458 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
JAK1P23458 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
JAK1P23458 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
JAK1P23458 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
JAK1P23458 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
JAK1P23458 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
JAK1P23458 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
JAK1P23458 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
JAK1P23458 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
JAK1P23458 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
JAK1P23458 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
JAK1P23458 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
JAK1P23458 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
JAK1P23458 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
JAK1P23458 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
JAK1P23458 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
JAK1P23458 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
JAK1P23458 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
JAK1P23458 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
JAK1P23458 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
JAK1P23458 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
JAK1P23458 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
JAK1P23458 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
JAK1P23458 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
JAK1P23458 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
JAK1P23458 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
JAK1P23458 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
JAK1P23458 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
JAK1P23458 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
JAK1P23458 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
JAK1P23458 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
JAK1P23458 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
JAK1P23458 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
JAK1P23458 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
JAK1P23458 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
JAK1P23458 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
JAK1P23458 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
JAK1P23458 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
JAK1P23458 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
JAK1P23458 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
JAK1P23458 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
JAK1P23458 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
JAK1P23458 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
JAK1P23458 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
JAK1P23458 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
JAK1P23458 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
JAK1P23458 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
JAK1P23458 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
JAK1P23458 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
JAK1P23458 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
JAK1P23458 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
JAK1P23458 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
JAK1P23458 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
JAK1P23458 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
JAK1P23458 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
JAK1P23458 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
JAK1P23458 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
JAK1P23458 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
JAK1P23458 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
JAK1P23458 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
JAK1P23458 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
JAK1P23458 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
JAK1P23458 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
JAK1P23458 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
JAK1P23458 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
JAK1P23458 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
JAK1P23458 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
JAK1P23458 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
JAK1P23458 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
JAK1P23458 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
JAK1P23458 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
JAK1P23458 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
JAK1P23458 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
JAK1P23458 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
JAK1P23458 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
JAK1P23458 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.5 ms