Protein–RNA interactions for Protein: P22528

SPRR1B, Cornifin-B, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRR1BP22528 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPRR1BP22528 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPRR1BP22528 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPRR1BP22528 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPRR1BP22528 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPRR1BP22528 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPRR1BP22528 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPRR1BP22528 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPRR1BP22528 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPRR1BP22528 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPRR1BP22528 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPRR1BP22528 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPRR1BP22528 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPRR1BP22528 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPRR1BP22528 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPRR1BP22528 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPRR1BP22528 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPRR1BP22528 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SPRR1BP22528 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPRR1BP22528 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPRR1BP22528 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPRR1BP22528 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPRR1BP22528 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPRR1BP22528 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPRR1BP22528 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPRR1BP22528 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPRR1BP22528 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPRR1BP22528 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPRR1BP22528 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPRR1BP22528 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SPRR1BP22528 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPRR1BP22528 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPRR1BP22528 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPRR1BP22528 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPRR1BP22528 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPRR1BP22528 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPRR1BP22528 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPRR1BP22528 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPRR1BP22528 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SPRR1BP22528 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPRR1BP22528 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPRR1BP22528 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPRR1BP22528 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPRR1BP22528 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPRR1BP22528 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPRR1BP22528 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPRR1BP22528 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPRR1BP22528 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPRR1BP22528 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPRR1BP22528 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPRR1BP22528 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPRR1BP22528 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPRR1BP22528 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPRR1BP22528 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPRR1BP22528 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPRR1BP22528 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPRR1BP22528 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPRR1BP22528 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPRR1BP22528 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPRR1BP22528 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPRR1BP22528 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPRR1BP22528 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPRR1BP22528 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPRR1BP22528 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPRR1BP22528 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPRR1BP22528 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPRR1BP22528 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPRR1BP22528 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPRR1BP22528 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPRR1BP22528 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPRR1BP22528 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPRR1BP22528 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPRR1BP22528 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SPRR1BP22528 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPRR1BP22528 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPRR1BP22528 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPRR1BP22528 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPRR1BP22528 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPRR1BP22528 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPRR1BP22528 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPRR1BP22528 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SPRR1BP22528 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SPRR1BP22528 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPRR1BP22528 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPRR1BP22528 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPRR1BP22528 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPRR1BP22528 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPRR1BP22528 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SPRR1BP22528 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPRR1BP22528 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPRR1BP22528 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPRR1BP22528 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPRR1BP22528 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPRR1BP22528 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPRR1BP22528 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPRR1BP22528 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPRR1BP22528 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPRR1BP22528 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPRR1BP22528 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPRR1BP22528 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.8 ms