Protein–RNA interactions for Protein: P21579

SYT1, Synaptotagmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT1P21579 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
SYT1P21579 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
SYT1P21579 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC32.51■■■□□ 2.79
SYT1P21579 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
SYT1P21579 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
SYT1P21579 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC32.44■■■□□ 2.78
SYT1P21579 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC32.43■■■□□ 2.78
SYT1P21579 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
SYT1P21579 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
SYT1P21579 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC32.42■■■□□ 2.78
SYT1P21579 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
SYT1P21579 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
SYT1P21579 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
SYT1P21579 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
SYT1P21579 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
SYT1P21579 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
SYT1P21579 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
SYT1P21579 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
SYT1P21579 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC32.33■■■□□ 2.77
SYT1P21579 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.77
SYT1P21579 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.77
SYT1P21579 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC32.32■■■□□ 2.76
SYT1P21579 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
SYT1P21579 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
SYT1P21579 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
SYT1P21579 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
SYT1P21579 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
SYT1P21579 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
SYT1P21579 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC32.28■■■□□ 2.76
SYT1P21579 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
SYT1P21579 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.75
SYT1P21579 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
SYT1P21579 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
SYT1P21579 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
SYT1P21579 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
SYT1P21579 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
SYT1P21579 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
SYT1P21579 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
SYT1P21579 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
SYT1P21579 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
SYT1P21579 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
SYT1P21579 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
SYT1P21579 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
SYT1P21579 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC32.15■■■□□ 2.74
SYT1P21579 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
SYT1P21579 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
SYT1P21579 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
SYT1P21579 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
SYT1P21579 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
SYT1P21579 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
SYT1P21579 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC32.1■■■□□ 2.73
SYT1P21579 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
SYT1P21579 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
SYT1P21579 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
SYT1P21579 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
SYT1P21579 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
SYT1P21579 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
SYT1P21579 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
SYT1P21579 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
SYT1P21579 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
SYT1P21579 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
SYT1P21579 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
SYT1P21579 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
SYT1P21579 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC31.99■■■□□ 2.71
SYT1P21579 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
SYT1P21579 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
SYT1P21579 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
SYT1P21579 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
SYT1P21579 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
SYT1P21579 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
SYT1P21579 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
SYT1P21579 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
SYT1P21579 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
SYT1P21579 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC31.91■■■□□ 2.7
SYT1P21579 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
SYT1P21579 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
SYT1P21579 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
SYT1P21579 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
SYT1P21579 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
SYT1P21579 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC31.9■■■□□ 2.7
SYT1P21579 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
SYT1P21579 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
SYT1P21579 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
SYT1P21579 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
SYT1P21579 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
SYT1P21579 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
SYT1P21579 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
SYT1P21579 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
SYT1P21579 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
SYT1P21579 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
SYT1P21579 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.68
SYT1P21579 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
SYT1P21579 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
SYT1P21579 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
SYT1P21579 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
SYT1P21579 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
SYT1P21579 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
SYT1P21579 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
SYT1P21579 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
SYT1P21579 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.6 ms