Protein–RNA interactions for Protein: P20823

HNF1A, Hepatocyte nuclear factor 1-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNF1AP20823 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HNF1AP20823 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
HNF1AP20823 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HNF1AP20823 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HNF1AP20823 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HNF1AP20823 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HNF1AP20823 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HNF1AP20823 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HNF1AP20823 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HNF1AP20823 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HNF1AP20823 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HNF1AP20823 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HNF1AP20823 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
HNF1AP20823 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HNF1AP20823 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HNF1AP20823 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HNF1AP20823 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HNF1AP20823 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HNF1AP20823 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
HNF1AP20823 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
HNF1AP20823 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HNF1AP20823 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HNF1AP20823 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HNF1AP20823 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HNF1AP20823 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HNF1AP20823 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HNF1AP20823 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
HNF1AP20823 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
HNF1AP20823 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HNF1AP20823 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HNF1AP20823 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HNF1AP20823 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HNF1AP20823 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HNF1AP20823 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
HNF1AP20823 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HNF1AP20823 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
HNF1AP20823 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HNF1AP20823 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HNF1AP20823 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HNF1AP20823 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HNF1AP20823 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HNF1AP20823 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HNF1AP20823 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HNF1AP20823 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HNF1AP20823 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HNF1AP20823 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HNF1AP20823 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HNF1AP20823 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HNF1AP20823 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HNF1AP20823 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HNF1AP20823 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HNF1AP20823 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HNF1AP20823 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HNF1AP20823 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HNF1AP20823 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HNF1AP20823 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HNF1AP20823 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HNF1AP20823 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HNF1AP20823 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HNF1AP20823 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HNF1AP20823 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HNF1AP20823 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HNF1AP20823 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HNF1AP20823 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HNF1AP20823 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HNF1AP20823 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
HNF1AP20823 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HNF1AP20823 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HNF1AP20823 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HNF1AP20823 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HNF1AP20823 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HNF1AP20823 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HNF1AP20823 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HNF1AP20823 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HNF1AP20823 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HNF1AP20823 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
HNF1AP20823 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
HNF1AP20823 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HNF1AP20823 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HNF1AP20823 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HNF1AP20823 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HNF1AP20823 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HNF1AP20823 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HNF1AP20823 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HNF1AP20823 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HNF1AP20823 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HNF1AP20823 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HNF1AP20823 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
HNF1AP20823 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
HNF1AP20823 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
HNF1AP20823 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HNF1AP20823 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
HNF1AP20823 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
HNF1AP20823 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HNF1AP20823 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HNF1AP20823 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HNF1AP20823 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HNF1AP20823 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
HNF1AP20823 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HNF1AP20823 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms