Protein–RNA interactions for Protein: P19429

TNNI3, Troponin I, cardiac muscle, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3P19429 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TNNI3P19429 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TNNI3P19429 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TNNI3P19429 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TNNI3P19429 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TNNI3P19429 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TNNI3P19429 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TNNI3P19429 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TNNI3P19429 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TNNI3P19429 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TNNI3P19429 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TNNI3P19429 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TNNI3P19429 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TNNI3P19429 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TNNI3P19429 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TNNI3P19429 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TNNI3P19429 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TNNI3P19429 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TNNI3P19429 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TNNI3P19429 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TNNI3P19429 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TNNI3P19429 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TNNI3P19429 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TNNI3P19429 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TNNI3P19429 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TNNI3P19429 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TNNI3P19429 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TNNI3P19429 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TNNI3P19429 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TNNI3P19429 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TNNI3P19429 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TNNI3P19429 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TNNI3P19429 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
TNNI3P19429 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TNNI3P19429 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TNNI3P19429 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TNNI3P19429 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TNNI3P19429 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TNNI3P19429 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
TNNI3P19429 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
TNNI3P19429 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TNNI3P19429 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TNNI3P19429 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TNNI3P19429 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TNNI3P19429 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TNNI3P19429 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TNNI3P19429 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TNNI3P19429 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TNNI3P19429 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TNNI3P19429 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TNNI3P19429 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TNNI3P19429 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TNNI3P19429 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
TNNI3P19429 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TNNI3P19429 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TNNI3P19429 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TNNI3P19429 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TNNI3P19429 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TNNI3P19429 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TNNI3P19429 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TNNI3P19429 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TNNI3P19429 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TNNI3P19429 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
TNNI3P19429 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TNNI3P19429 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TNNI3P19429 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TNNI3P19429 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TNNI3P19429 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TNNI3P19429 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TNNI3P19429 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TNNI3P19429 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TNNI3P19429 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TNNI3P19429 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TNNI3P19429 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TNNI3P19429 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TNNI3P19429 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TNNI3P19429 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TNNI3P19429 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TNNI3P19429 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TNNI3P19429 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TNNI3P19429 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TNNI3P19429 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TNNI3P19429 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TNNI3P19429 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TNNI3P19429 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TNNI3P19429 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TNNI3P19429 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TNNI3P19429 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TNNI3P19429 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
TNNI3P19429 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TNNI3P19429 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TNNI3P19429 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TNNI3P19429 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TNNI3P19429 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TNNI3P19429 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
TNNI3P19429 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TNNI3P19429 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TNNI3P19429 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TNNI3P19429 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TNNI3P19429 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms