Protein–RNA interactions for Protein: P18146

EGR1, Early growth response protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR1P18146 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EGR1P18146 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EGR1P18146 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EGR1P18146 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EGR1P18146 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EGR1P18146 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EGR1P18146 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EGR1P18146 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EGR1P18146 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EGR1P18146 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EGR1P18146 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EGR1P18146 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
EGR1P18146 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
EGR1P18146 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EGR1P18146 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
EGR1P18146 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EGR1P18146 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EGR1P18146 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EGR1P18146 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EGR1P18146 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EGR1P18146 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EGR1P18146 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EGR1P18146 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EGR1P18146 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EGR1P18146 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EGR1P18146 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EGR1P18146 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EGR1P18146 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EGR1P18146 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EGR1P18146 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EGR1P18146 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EGR1P18146 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EGR1P18146 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EGR1P18146 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EGR1P18146 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EGR1P18146 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EGR1P18146 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EGR1P18146 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EGR1P18146 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EGR1P18146 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EGR1P18146 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EGR1P18146 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EGR1P18146 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EGR1P18146 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EGR1P18146 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EGR1P18146 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EGR1P18146 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EGR1P18146 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EGR1P18146 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EGR1P18146 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EGR1P18146 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EGR1P18146 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EGR1P18146 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EGR1P18146 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EGR1P18146 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
EGR1P18146 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EGR1P18146 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EGR1P18146 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EGR1P18146 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EGR1P18146 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EGR1P18146 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EGR1P18146 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EGR1P18146 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EGR1P18146 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EGR1P18146 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
EGR1P18146 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
EGR1P18146 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EGR1P18146 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EGR1P18146 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EGR1P18146 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EGR1P18146 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
EGR1P18146 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EGR1P18146 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EGR1P18146 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EGR1P18146 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EGR1P18146 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EGR1P18146 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EGR1P18146 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EGR1P18146 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EGR1P18146 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
EGR1P18146 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EGR1P18146 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EGR1P18146 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
EGR1P18146 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EGR1P18146 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EGR1P18146 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EGR1P18146 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EGR1P18146 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EGR1P18146 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EGR1P18146 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EGR1P18146 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
EGR1P18146 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EGR1P18146 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EGR1P18146 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
EGR1P18146 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EGR1P18146 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EGR1P18146 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EGR1P18146 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EGR1P18146 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EGR1P18146 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms