Protein–RNA interactions for Protein: P16144

ITGB4, Integrin beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB4P16144 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC36.85■■■■□ 3.49
ITGB4P16144 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
ITGB4P16144 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
ITGB4P16144 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
ITGB4P16144 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
ITGB4P16144 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
ITGB4P16144 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
ITGB4P16144 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC36.67■■■■□ 3.46
ITGB4P16144 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC36.67■■■■□ 3.46
ITGB4P16144 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC36.67■■■■□ 3.46
ITGB4P16144 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
ITGB4P16144 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.61■■■■□ 3.45
ITGB4P16144 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC36.61■■■■□ 3.45
ITGB4P16144 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC36.61■■■■□ 3.45
ITGB4P16144 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC36.52■■■■□ 3.44
ITGB4P16144 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.51■■■■□ 3.44
ITGB4P16144 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC36.51■■■■□ 3.44
ITGB4P16144 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
ITGB4P16144 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC36.51■■■■□ 3.44
ITGB4P16144 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.5■■■■□ 3.43
ITGB4P16144 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC36.5■■■■□ 3.43
ITGB4P16144 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
ITGB4P16144 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
ITGB4P16144 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
ITGB4P16144 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC36.49■■■■□ 3.43
ITGB4P16144 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC36.48■■■■□ 3.43
ITGB4P16144 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
ITGB4P16144 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC36.45■■■■□ 3.43
ITGB4P16144 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
ITGB4P16144 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.43
ITGB4P16144 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC36.45■■■■□ 3.43
ITGB4P16144 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
ITGB4P16144 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
ITGB4P16144 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
ITGB4P16144 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
ITGB4P16144 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC36.41■■■■□ 3.42
ITGB4P16144 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.38■■■■□ 3.42
ITGB4P16144 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.38■■■■□ 3.42
ITGB4P16144 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
ITGB4P16144 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC36.37■■■■□ 3.41
ITGB4P16144 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
ITGB4P16144 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
ITGB4P16144 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
ITGB4P16144 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC36.34■■■■□ 3.41
ITGB4P16144 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
ITGB4P16144 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
ITGB4P16144 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
ITGB4P16144 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
ITGB4P16144 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
ITGB4P16144 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC36.29■■■■□ 3.4
ITGB4P16144 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC36.29■■■■□ 3.4
ITGB4P16144 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
ITGB4P16144 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
ITGB4P16144 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC36.27■■■■□ 3.4
ITGB4P16144 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
ITGB4P16144 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
ITGB4P16144 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
ITGB4P16144 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
ITGB4P16144 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC36.24■■■■□ 3.39
ITGB4P16144 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
ITGB4P16144 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
ITGB4P16144 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC36.24■■■■□ 3.39
ITGB4P16144 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
ITGB4P16144 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC36.21■■■■□ 3.39
ITGB4P16144 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC36.2■■■■□ 3.39
ITGB4P16144 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
ITGB4P16144 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.38
ITGB4P16144 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
ITGB4P16144 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC36.19■■■■□ 3.38
ITGB4P16144 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
ITGB4P16144 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.37
ITGB4P16144 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC36.13■■■■□ 3.37
ITGB4P16144 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC36.13■■■■□ 3.37
ITGB4P16144 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
ITGB4P16144 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
ITGB4P16144 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.08■■■■□ 3.37
ITGB4P16144 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
ITGB4P16144 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
ITGB4P16144 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC36.07■■■■□ 3.36
ITGB4P16144 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.36
ITGB4P16144 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
ITGB4P16144 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC36.04■■■■□ 3.36
ITGB4P16144 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
ITGB4P16144 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
ITGB4P16144 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
ITGB4P16144 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC35.99■■■■□ 3.35
ITGB4P16144 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
ITGB4P16144 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
ITGB4P16144 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
ITGB4P16144 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC35.95■■■■□ 3.35
ITGB4P16144 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC35.94■■■■□ 3.34
ITGB4P16144 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC35.93■■■■□ 3.34
ITGB4P16144 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC35.88■■■■□ 3.33
ITGB4P16144 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC35.87■■■■□ 3.33
ITGB4P16144 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
ITGB4P16144 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC35.87■■■■□ 3.33
ITGB4P16144 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC35.87■■■■□ 3.33
ITGB4P16144 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
ITGB4P16144 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC35.85■■■■□ 3.33
ITGB4P16144 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC35.85■■■■□ 3.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms