Protein–RNA interactions for Protein: P16144

ITGB4, Integrin beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB4P16144 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC45.25■■■■■ 4.83
ITGB4P16144 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC44.74■■■■■ 4.75
ITGB4P16144 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC44.24■■■■■ 4.67
ITGB4P16144 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.14■■■■■ 4.66
ITGB4P16144 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.8■■■■■ 4.6
ITGB4P16144 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.61■■■■■ 4.57
ITGB4P16144 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.41■■■■■ 4.54
ITGB4P16144 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC43.27■■■■■ 4.52
ITGB4P16144 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.9■■■■■ 4.46
ITGB4P16144 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC42.79■■■■■ 4.44
ITGB4P16144 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC42.71■■■■■ 4.43
ITGB4P16144 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC42.64■■■■■ 4.42
ITGB4P16144 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.63■■■■■ 4.41
ITGB4P16144 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC42.43■■■■■ 4.38
ITGB4P16144 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.41■■■■■ 4.38
ITGB4P16144 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC42.34■■■■■ 4.37
ITGB4P16144 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.16■■■■■ 4.34
ITGB4P16144 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.12■■■■■ 4.33
ITGB4P16144 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.02■■■■■ 4.32
ITGB4P16144 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC41.8■■■■■ 4.28
ITGB4P16144 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.6■■■■■ 4.25
ITGB4P16144 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC41.6■■■■■ 4.25
ITGB4P16144 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.51■■■■■ 4.23
ITGB4P16144 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.5■■■■■ 4.23
ITGB4P16144 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC41.42■■■■■ 4.22
ITGB4P16144 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.4■■■■■ 4.22
ITGB4P16144 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC41.36■■■■■ 4.21
ITGB4P16144 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.3■■■■■ 4.2
ITGB4P16144 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.24■■■■■ 4.19
ITGB4P16144 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC41.21■■■■■ 4.19
ITGB4P16144 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC41.15■■■■■ 4.18
ITGB4P16144 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.14■■■■■ 4.18
ITGB4P16144 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC40.86■■■■■ 4.13
ITGB4P16144 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC40.81■■■■■ 4.12
ITGB4P16144 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC40.74■■■■■ 4.11
ITGB4P16144 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC40.67■■■■■ 4.1
ITGB4P16144 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC40.64■■■■■ 4.1
ITGB4P16144 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.59■■■■■ 4.09
ITGB4P16144 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC40.45■■■■■ 4.07
ITGB4P16144 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
ITGB4P16144 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
ITGB4P16144 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
ITGB4P16144 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
ITGB4P16144 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.01■■■■■ 4
ITGB4P16144 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC40■■■■□ 3.99
ITGB4P16144 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
ITGB4P16144 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
ITGB4P16144 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
ITGB4P16144 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC39.85■■■■□ 3.97
ITGB4P16144 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC39.8■■■■□ 3.96
ITGB4P16144 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC39.65■■■■□ 3.94
ITGB4P16144 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
ITGB4P16144 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
ITGB4P16144 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC39.51■■■■□ 3.92
ITGB4P16144 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC39.51■■■■□ 3.92
ITGB4P16144 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
ITGB4P16144 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC39.42■■■■□ 3.9
ITGB4P16144 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
ITGB4P16144 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
ITGB4P16144 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC39.37■■■■□ 3.89
ITGB4P16144 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.35■■■■□ 3.89
ITGB4P16144 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC39.26■■■■□ 3.88
ITGB4P16144 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
ITGB4P16144 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
ITGB4P16144 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC39.23■■■■□ 3.87
ITGB4P16144 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
ITGB4P16144 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
ITGB4P16144 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
ITGB4P16144 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.17■■■■□ 3.86
ITGB4P16144 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
ITGB4P16144 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
ITGB4P16144 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
ITGB4P16144 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC39.12■■■■□ 3.85
ITGB4P16144 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
ITGB4P16144 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
ITGB4P16144 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.96■■■■□ 3.83
ITGB4P16144 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
ITGB4P16144 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
ITGB4P16144 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC38.89■■■■□ 3.82
ITGB4P16144 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.88■■■■□ 3.82
ITGB4P16144 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
ITGB4P16144 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC38.85■■■■□ 3.81
ITGB4P16144 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC38.83■■■■□ 3.81
ITGB4P16144 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.81
ITGB4P16144 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC38.82■■■■□ 3.8
ITGB4P16144 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC38.79■■■■□ 3.8
ITGB4P16144 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
ITGB4P16144 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.75■■■■□ 3.79
ITGB4P16144 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
ITGB4P16144 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC38.71■■■■□ 3.79
ITGB4P16144 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
ITGB4P16144 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC38.68■■■■□ 3.78
ITGB4P16144 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC38.68■■■■□ 3.78
ITGB4P16144 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
ITGB4P16144 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC38.63■■■■□ 3.77
ITGB4P16144 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.58■■■■□ 3.77
ITGB4P16144 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.57■■■■□ 3.76
ITGB4P16144 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC38.56■■■■□ 3.76
ITGB4P16144 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC38.56■■■■□ 3.76
ITGB4P16144 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms