Protein–RNA interactions for Protein: P15923

TCF3, Transcription factor E2-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF3P15923 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TCF3P15923 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TCF3P15923 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TCF3P15923 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TCF3P15923 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TCF3P15923 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29■■■□□ 2.23
TCF3P15923 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
TCF3P15923 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TCF3P15923 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TCF3P15923 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TCF3P15923 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
TCF3P15923 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TCF3P15923 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TCF3P15923 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
TCF3P15923 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
TCF3P15923 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
TCF3P15923 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TCF3P15923 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TCF3P15923 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
TCF3P15923 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TCF3P15923 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TCF3P15923 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
TCF3P15923 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TCF3P15923 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TCF3P15923 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TCF3P15923 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TCF3P15923 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TCF3P15923 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TCF3P15923 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TCF3P15923 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TCF3P15923 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TCF3P15923 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TCF3P15923 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TCF3P15923 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TCF3P15923 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TCF3P15923 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TCF3P15923 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TCF3P15923 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TCF3P15923 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TCF3P15923 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TCF3P15923 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
TCF3P15923 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TCF3P15923 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TCF3P15923 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TCF3P15923 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
TCF3P15923 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
TCF3P15923 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TCF3P15923 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TCF3P15923 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
TCF3P15923 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TCF3P15923 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TCF3P15923 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TCF3P15923 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TCF3P15923 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TCF3P15923 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TCF3P15923 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TCF3P15923 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TCF3P15923 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TCF3P15923 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TCF3P15923 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TCF3P15923 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TCF3P15923 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TCF3P15923 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TCF3P15923 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TCF3P15923 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TCF3P15923 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TCF3P15923 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TCF3P15923 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TCF3P15923 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TCF3P15923 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
TCF3P15923 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TCF3P15923 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TCF3P15923 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TCF3P15923 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TCF3P15923 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TCF3P15923 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TCF3P15923 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
TCF3P15923 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TCF3P15923 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TCF3P15923 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
TCF3P15923 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TCF3P15923 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TCF3P15923 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TCF3P15923 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TCF3P15923 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TCF3P15923 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
TCF3P15923 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TCF3P15923 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TCF3P15923 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TCF3P15923 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TCF3P15923 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TCF3P15923 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
TCF3P15923 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TCF3P15923 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TCF3P15923 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
TCF3P15923 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TCF3P15923 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TCF3P15923 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TCF3P15923 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TCF3P15923 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms