Protein–RNA interactions for Protein: P15336

ATF2, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-2, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF2P15336 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
ATF2P15336 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
ATF2P15336 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
ATF2P15336 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
ATF2P15336 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
ATF2P15336 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC29.84■■■□□ 2.37
ATF2P15336 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
ATF2P15336 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
ATF2P15336 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC29.83■■■□□ 2.37
ATF2P15336 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
ATF2P15336 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
ATF2P15336 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
ATF2P15336 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
ATF2P15336 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
ATF2P15336 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
ATF2P15336 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
ATF2P15336 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
ATF2P15336 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
ATF2P15336 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
ATF2P15336 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
ATF2P15336 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
ATF2P15336 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
ATF2P15336 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
ATF2P15336 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
ATF2P15336 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
ATF2P15336 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
ATF2P15336 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
ATF2P15336 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
ATF2P15336 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
ATF2P15336 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
ATF2P15336 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
ATF2P15336 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
ATF2P15336 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
ATF2P15336 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
ATF2P15336 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ATF2P15336 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
ATF2P15336 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
ATF2P15336 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
ATF2P15336 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
ATF2P15336 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
ATF2P15336 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
ATF2P15336 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
ATF2P15336 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
ATF2P15336 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
ATF2P15336 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ATF2P15336 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ATF2P15336 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
ATF2P15336 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
ATF2P15336 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
ATF2P15336 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ATF2P15336 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
ATF2P15336 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ATF2P15336 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ATF2P15336 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
ATF2P15336 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
ATF2P15336 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
ATF2P15336 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ATF2P15336 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
ATF2P15336 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ATF2P15336 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
ATF2P15336 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
ATF2P15336 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
ATF2P15336 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
ATF2P15336 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
ATF2P15336 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
ATF2P15336 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
ATF2P15336 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ATF2P15336 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
ATF2P15336 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
ATF2P15336 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
ATF2P15336 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
ATF2P15336 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
ATF2P15336 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
ATF2P15336 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
ATF2P15336 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ATF2P15336 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ATF2P15336 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ATF2P15336 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ATF2P15336 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ATF2P15336 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ATF2P15336 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ATF2P15336 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
ATF2P15336 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
ATF2P15336 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ATF2P15336 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ATF2P15336 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ATF2P15336 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ATF2P15336 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ATF2P15336 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ATF2P15336 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
ATF2P15336 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
ATF2P15336 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ATF2P15336 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ATF2P15336 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ATF2P15336 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ATF2P15336 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ATF2P15336 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
ATF2P15336 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ATF2P15336 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ATF2P15336 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms