Protein–RNA interactions for Protein: P14854

COX6B1, Cytochrome c oxidase subunit 6B1, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX6B1P14854 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
COX6B1P14854 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
COX6B1P14854 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
COX6B1P14854 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
COX6B1P14854 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
COX6B1P14854 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
COX6B1P14854 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
COX6B1P14854 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
COX6B1P14854 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
COX6B1P14854 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
COX6B1P14854 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
COX6B1P14854 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
COX6B1P14854 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
COX6B1P14854 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
COX6B1P14854 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
COX6B1P14854 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
COX6B1P14854 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
COX6B1P14854 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
COX6B1P14854 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
COX6B1P14854 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
COX6B1P14854 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
COX6B1P14854 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
COX6B1P14854 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
COX6B1P14854 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
COX6B1P14854 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
COX6B1P14854 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
COX6B1P14854 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
COX6B1P14854 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
COX6B1P14854 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
COX6B1P14854 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
COX6B1P14854 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
COX6B1P14854 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
COX6B1P14854 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
COX6B1P14854 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
COX6B1P14854 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
COX6B1P14854 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
COX6B1P14854 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
COX6B1P14854 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
COX6B1P14854 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
COX6B1P14854 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
COX6B1P14854 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
COX6B1P14854 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
COX6B1P14854 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
COX6B1P14854 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
COX6B1P14854 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
COX6B1P14854 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
COX6B1P14854 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
COX6B1P14854 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
COX6B1P14854 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
COX6B1P14854 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
COX6B1P14854 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
COX6B1P14854 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
COX6B1P14854 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
COX6B1P14854 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
COX6B1P14854 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
COX6B1P14854 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
COX6B1P14854 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
COX6B1P14854 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
COX6B1P14854 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
COX6B1P14854 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
COX6B1P14854 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
COX6B1P14854 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
COX6B1P14854 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
COX6B1P14854 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
COX6B1P14854 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
COX6B1P14854 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
COX6B1P14854 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
COX6B1P14854 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
COX6B1P14854 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
COX6B1P14854 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COX6B1P14854 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COX6B1P14854 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
COX6B1P14854 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
COX6B1P14854 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
COX6B1P14854 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
COX6B1P14854 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
COX6B1P14854 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
COX6B1P14854 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
COX6B1P14854 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
COX6B1P14854 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
COX6B1P14854 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
COX6B1P14854 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
COX6B1P14854 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
COX6B1P14854 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
COX6B1P14854 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
COX6B1P14854 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
COX6B1P14854 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
COX6B1P14854 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
COX6B1P14854 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
COX6B1P14854 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
COX6B1P14854 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
COX6B1P14854 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
COX6B1P14854 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
COX6B1P14854 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
COX6B1P14854 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
COX6B1P14854 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
COX6B1P14854 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
COX6B1P14854 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
COX6B1P14854 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
COX6B1P14854 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms