Protein–RNA interactions for Protein: P13682

ZNF35, Zinc finger protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF35P13682 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF35P13682 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF35P13682 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF35P13682 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF35P13682 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF35P13682 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF35P13682 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF35P13682 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF35P13682 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZNF35P13682 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZNF35P13682 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZNF35P13682 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZNF35P13682 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF35P13682 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF35P13682 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF35P13682 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF35P13682 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF35P13682 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF35P13682 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF35P13682 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF35P13682 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF35P13682 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ZNF35P13682 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF35P13682 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF35P13682 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF35P13682 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF35P13682 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF35P13682 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF35P13682 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF35P13682 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF35P13682 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF35P13682 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF35P13682 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF35P13682 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF35P13682 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF35P13682 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF35P13682 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF35P13682 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF35P13682 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF35P13682 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF35P13682 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF35P13682 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF35P13682 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF35P13682 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF35P13682 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF35P13682 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF35P13682 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF35P13682 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF35P13682 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF35P13682 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ZNF35P13682 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ZNF35P13682 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZNF35P13682 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF35P13682 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF35P13682 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF35P13682 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF35P13682 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF35P13682 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF35P13682 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF35P13682 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF35P13682 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF35P13682 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF35P13682 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF35P13682 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF35P13682 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF35P13682 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF35P13682 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF35P13682 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF35P13682 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF35P13682 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF35P13682 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF35P13682 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF35P13682 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF35P13682 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF35P13682 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF35P13682 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF35P13682 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF35P13682 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF35P13682 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF35P13682 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZNF35P13682 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF35P13682 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF35P13682 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF35P13682 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF35P13682 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF35P13682 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF35P13682 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF35P13682 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF35P13682 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF35P13682 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF35P13682 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF35P13682 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF35P13682 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNF35P13682 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNF35P13682 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNF35P13682 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNF35P13682 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF35P13682 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF35P13682 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF35P13682 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms