Protein–RNA interactions for Protein: P12110

COL6A2, Collagen alpha-2(VI) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,019 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL6A2P12110 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
COL6A2P12110 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
COL6A2P12110 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
COL6A2P12110 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
COL6A2P12110 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
COL6A2P12110 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
COL6A2P12110 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
COL6A2P12110 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
COL6A2P12110 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
COL6A2P12110 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
COL6A2P12110 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
COL6A2P12110 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
COL6A2P12110 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
COL6A2P12110 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
COL6A2P12110 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
COL6A2P12110 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
COL6A2P12110 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
COL6A2P12110 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
COL6A2P12110 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
COL6A2P12110 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
COL6A2P12110 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
COL6A2P12110 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
COL6A2P12110 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
COL6A2P12110 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
COL6A2P12110 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
COL6A2P12110 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
COL6A2P12110 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
COL6A2P12110 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
COL6A2P12110 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
COL6A2P12110 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
COL6A2P12110 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
COL6A2P12110 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
COL6A2P12110 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
COL6A2P12110 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
COL6A2P12110 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
COL6A2P12110 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
COL6A2P12110 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
COL6A2P12110 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
COL6A2P12110 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
COL6A2P12110 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
COL6A2P12110 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
COL6A2P12110 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
COL6A2P12110 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
COL6A2P12110 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
COL6A2P12110 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
COL6A2P12110 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
COL6A2P12110 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
COL6A2P12110 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
COL6A2P12110 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
COL6A2P12110 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
COL6A2P12110 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
COL6A2P12110 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
COL6A2P12110 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
COL6A2P12110 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
COL6A2P12110 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
COL6A2P12110 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
COL6A2P12110 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
COL6A2P12110 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
COL6A2P12110 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
COL6A2P12110 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
COL6A2P12110 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
COL6A2P12110 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
COL6A2P12110 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
COL6A2P12110 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
COL6A2P12110 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
COL6A2P12110 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
COL6A2P12110 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
COL6A2P12110 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
COL6A2P12110 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
COL6A2P12110 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
COL6A2P12110 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
COL6A2P12110 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
COL6A2P12110 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
COL6A2P12110 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
COL6A2P12110 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
COL6A2P12110 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
COL6A2P12110 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
COL6A2P12110 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
COL6A2P12110 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
COL6A2P12110 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
COL6A2P12110 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
COL6A2P12110 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
COL6A2P12110 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27■■□□□ 1.91
COL6A2P12110 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
COL6A2P12110 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
COL6A2P12110 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
COL6A2P12110 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
COL6A2P12110 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
COL6A2P12110 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
COL6A2P12110 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
COL6A2P12110 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
COL6A2P12110 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
COL6A2P12110 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
COL6A2P12110 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
COL6A2P12110 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
COL6A2P12110 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
COL6A2P12110 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
COL6A2P12110 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
COL6A2P12110 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
COL6A2P12110 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms