Protein–RNA interactions for Protein: P11473

VDR, Vitamin D3 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VDRP11473 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
VDRP11473 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
VDRP11473 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
VDRP11473 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
VDRP11473 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
VDRP11473 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
VDRP11473 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
VDRP11473 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
VDRP11473 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
VDRP11473 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
VDRP11473 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
VDRP11473 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
VDRP11473 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
VDRP11473 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
VDRP11473 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
VDRP11473 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
VDRP11473 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
VDRP11473 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
VDRP11473 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
VDRP11473 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
VDRP11473 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
VDRP11473 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
VDRP11473 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
VDRP11473 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
VDRP11473 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
VDRP11473 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
VDRP11473 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
VDRP11473 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
VDRP11473 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
VDRP11473 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
VDRP11473 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
VDRP11473 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
VDRP11473 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
VDRP11473 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
VDRP11473 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
VDRP11473 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
VDRP11473 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
VDRP11473 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
VDRP11473 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
VDRP11473 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
VDRP11473 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
VDRP11473 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC29.23■■■□□ 2.27
VDRP11473 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
VDRP11473 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
VDRP11473 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
VDRP11473 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
VDRP11473 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
VDRP11473 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
VDRP11473 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
VDRP11473 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
VDRP11473 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
VDRP11473 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
VDRP11473 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
VDRP11473 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
VDRP11473 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
VDRP11473 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
VDRP11473 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.26
VDRP11473 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
VDRP11473 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
VDRP11473 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
VDRP11473 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
VDRP11473 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
VDRP11473 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
VDRP11473 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
VDRP11473 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
VDRP11473 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
VDRP11473 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
VDRP11473 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
VDRP11473 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
VDRP11473 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
VDRP11473 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
VDRP11473 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
VDRP11473 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
VDRP11473 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
VDRP11473 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
VDRP11473 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
VDRP11473 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
VDRP11473 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
VDRP11473 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
VDRP11473 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
VDRP11473 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.24
VDRP11473 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
VDRP11473 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
VDRP11473 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
VDRP11473 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
VDRP11473 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
VDRP11473 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
VDRP11473 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
VDRP11473 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
VDRP11473 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
VDRP11473 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
VDRP11473 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
VDRP11473 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
VDRP11473 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
VDRP11473 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
VDRP11473 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
VDRP11473 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
VDRP11473 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
VDRP11473 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
VDRP11473 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.5 ms