Protein–RNA interactions for Protein: P10909

CLU, Clusterin, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLUP10909 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CLUP10909 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CLUP10909 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLUP10909 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLUP10909 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLUP10909 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLUP10909 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLUP10909 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLUP10909 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CLUP10909 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CLUP10909 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLUP10909 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLUP10909 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLUP10909 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLUP10909 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLUP10909 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLUP10909 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLUP10909 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CLUP10909 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLUP10909 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLUP10909 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLUP10909 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLUP10909 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CLUP10909 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLUP10909 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLUP10909 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLUP10909 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLUP10909 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLUP10909 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLUP10909 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLUP10909 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLUP10909 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLUP10909 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLUP10909 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLUP10909 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLUP10909 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLUP10909 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLUP10909 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLUP10909 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLUP10909 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLUP10909 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLUP10909 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLUP10909 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CLUP10909 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLUP10909 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLUP10909 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CLUP10909 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLUP10909 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLUP10909 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLUP10909 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLUP10909 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CLUP10909 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLUP10909 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLUP10909 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLUP10909 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLUP10909 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLUP10909 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CLUP10909 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLUP10909 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLUP10909 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLUP10909 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLUP10909 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLUP10909 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLUP10909 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLUP10909 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CLUP10909 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLUP10909 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLUP10909 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLUP10909 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLUP10909 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CLUP10909 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLUP10909 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLUP10909 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLUP10909 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLUP10909 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLUP10909 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLUP10909 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLUP10909 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLUP10909 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLUP10909 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLUP10909 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLUP10909 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLUP10909 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLUP10909 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLUP10909 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLUP10909 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLUP10909 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLUP10909 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLUP10909 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLUP10909 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLUP10909 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLUP10909 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CLUP10909 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLUP10909 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLUP10909 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLUP10909 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLUP10909 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLUP10909 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLUP10909 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLUP10909 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms