Protein–RNA interactions for Protein: P0DKB5

TPBGL, Trophoblast glycoprotein-like, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPBGLP0DKB5 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TPBGLP0DKB5 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TPBGLP0DKB5 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TPBGLP0DKB5 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TPBGLP0DKB5 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TPBGLP0DKB5 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TPBGLP0DKB5 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TPBGLP0DKB5 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TPBGLP0DKB5 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TPBGLP0DKB5 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TPBGLP0DKB5 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TPBGLP0DKB5 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TPBGLP0DKB5 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TPBGLP0DKB5 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
TPBGLP0DKB5 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TPBGLP0DKB5 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TPBGLP0DKB5 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TPBGLP0DKB5 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TPBGLP0DKB5 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TPBGLP0DKB5 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TPBGLP0DKB5 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TPBGLP0DKB5 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TPBGLP0DKB5 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TPBGLP0DKB5 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TPBGLP0DKB5 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TPBGLP0DKB5 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TPBGLP0DKB5 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TPBGLP0DKB5 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TPBGLP0DKB5 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TPBGLP0DKB5 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TPBGLP0DKB5 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TPBGLP0DKB5 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
TPBGLP0DKB5 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TPBGLP0DKB5 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TPBGLP0DKB5 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TPBGLP0DKB5 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TPBGLP0DKB5 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TPBGLP0DKB5 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TPBGLP0DKB5 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TPBGLP0DKB5 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TPBGLP0DKB5 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TPBGLP0DKB5 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
TPBGLP0DKB5 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
TPBGLP0DKB5 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TPBGLP0DKB5 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
TPBGLP0DKB5 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
TPBGLP0DKB5 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TPBGLP0DKB5 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TPBGLP0DKB5 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
TPBGLP0DKB5 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TPBGLP0DKB5 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TPBGLP0DKB5 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TPBGLP0DKB5 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TPBGLP0DKB5 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TPBGLP0DKB5 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TPBGLP0DKB5 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TPBGLP0DKB5 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
TPBGLP0DKB5 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TPBGLP0DKB5 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TPBGLP0DKB5 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TPBGLP0DKB5 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TPBGLP0DKB5 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TPBGLP0DKB5 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TPBGLP0DKB5 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TPBGLP0DKB5 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TPBGLP0DKB5 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TPBGLP0DKB5 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TPBGLP0DKB5 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TPBGLP0DKB5 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TPBGLP0DKB5 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TPBGLP0DKB5 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TPBGLP0DKB5 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TPBGLP0DKB5 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TPBGLP0DKB5 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TPBGLP0DKB5 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TPBGLP0DKB5 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TPBGLP0DKB5 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TPBGLP0DKB5 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TPBGLP0DKB5 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TPBGLP0DKB5 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TPBGLP0DKB5 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TPBGLP0DKB5 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TPBGLP0DKB5 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TPBGLP0DKB5 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TPBGLP0DKB5 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TPBGLP0DKB5 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TPBGLP0DKB5 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TPBGLP0DKB5 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TPBGLP0DKB5 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TPBGLP0DKB5 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TPBGLP0DKB5 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TPBGLP0DKB5 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TPBGLP0DKB5 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TPBGLP0DKB5 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TPBGLP0DKB5 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TPBGLP0DKB5 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TPBGLP0DKB5 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TPBGLP0DKB5 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TPBGLP0DKB5 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TPBGLP0DKB5 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.5 ms