Protein–RNA interactions for Protein: P0C672

TSPAN19, Putative tetraspanin-19, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN19P0C672 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TSPAN19P0C672 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TSPAN19P0C672 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TSPAN19P0C672 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TSPAN19P0C672 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TSPAN19P0C672 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
TSPAN19P0C672 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TSPAN19P0C672 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TSPAN19P0C672 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TSPAN19P0C672 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TSPAN19P0C672 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TSPAN19P0C672 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TSPAN19P0C672 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TSPAN19P0C672 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TSPAN19P0C672 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TSPAN19P0C672 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TSPAN19P0C672 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TSPAN19P0C672 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TSPAN19P0C672 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TSPAN19P0C672 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TSPAN19P0C672 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TSPAN19P0C672 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TSPAN19P0C672 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TSPAN19P0C672 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TSPAN19P0C672 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TSPAN19P0C672 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TSPAN19P0C672 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TSPAN19P0C672 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TSPAN19P0C672 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TSPAN19P0C672 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TSPAN19P0C672 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TSPAN19P0C672 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TSPAN19P0C672 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TSPAN19P0C672 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TSPAN19P0C672 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TSPAN19P0C672 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TSPAN19P0C672 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TSPAN19P0C672 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TSPAN19P0C672 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TSPAN19P0C672 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TSPAN19P0C672 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TSPAN19P0C672 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TSPAN19P0C672 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TSPAN19P0C672 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TSPAN19P0C672 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TSPAN19P0C672 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TSPAN19P0C672 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TSPAN19P0C672 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TSPAN19P0C672 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TSPAN19P0C672 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TSPAN19P0C672 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TSPAN19P0C672 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TSPAN19P0C672 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TSPAN19P0C672 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TSPAN19P0C672 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TSPAN19P0C672 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TSPAN19P0C672 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TSPAN19P0C672 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TSPAN19P0C672 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
TSPAN19P0C672 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TSPAN19P0C672 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
TSPAN19P0C672 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TSPAN19P0C672 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TSPAN19P0C672 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TSPAN19P0C672 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TSPAN19P0C672 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TSPAN19P0C672 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TSPAN19P0C672 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TSPAN19P0C672 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TSPAN19P0C672 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TSPAN19P0C672 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TSPAN19P0C672 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TSPAN19P0C672 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TSPAN19P0C672 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TSPAN19P0C672 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TSPAN19P0C672 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TSPAN19P0C672 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
TSPAN19P0C672 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TSPAN19P0C672 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TSPAN19P0C672 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
TSPAN19P0C672 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TSPAN19P0C672 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TSPAN19P0C672 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TSPAN19P0C672 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TSPAN19P0C672 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TSPAN19P0C672 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TSPAN19P0C672 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TSPAN19P0C672 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TSPAN19P0C672 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TSPAN19P0C672 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TSPAN19P0C672 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TSPAN19P0C672 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TSPAN19P0C672 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TSPAN19P0C672 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
TSPAN19P0C672 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TSPAN19P0C672 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
TSPAN19P0C672 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TSPAN19P0C672 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TSPAN19P0C672 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TSPAN19P0C672 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8 ms