Protein–RNA interactions for Protein: P0C672

TSPAN19, Putative tetraspanin-19, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN19P0C672 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
TSPAN19P0C672 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
TSPAN19P0C672 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC30.35■■■□□ 2.45
TSPAN19P0C672 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC30.03■■■□□ 2.4
TSPAN19P0C672 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
TSPAN19P0C672 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
TSPAN19P0C672 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
TSPAN19P0C672 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
TSPAN19P0C672 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
TSPAN19P0C672 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TSPAN19P0C672 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TSPAN19P0C672 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TSPAN19P0C672 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TSPAN19P0C672 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TSPAN19P0C672 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TSPAN19P0C672 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TSPAN19P0C672 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TSPAN19P0C672 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TSPAN19P0C672 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TSPAN19P0C672 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TSPAN19P0C672 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TSPAN19P0C672 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TSPAN19P0C672 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TSPAN19P0C672 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TSPAN19P0C672 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TSPAN19P0C672 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TSPAN19P0C672 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TSPAN19P0C672 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TSPAN19P0C672 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TSPAN19P0C672 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TSPAN19P0C672 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TSPAN19P0C672 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TSPAN19P0C672 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TSPAN19P0C672 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TSPAN19P0C672 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TSPAN19P0C672 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TSPAN19P0C672 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TSPAN19P0C672 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TSPAN19P0C672 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TSPAN19P0C672 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
TSPAN19P0C672 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TSPAN19P0C672 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TSPAN19P0C672 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TSPAN19P0C672 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TSPAN19P0C672 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TSPAN19P0C672 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TSPAN19P0C672 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TSPAN19P0C672 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TSPAN19P0C672 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TSPAN19P0C672 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
TSPAN19P0C672 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TSPAN19P0C672 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TSPAN19P0C672 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TSPAN19P0C672 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TSPAN19P0C672 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TSPAN19P0C672 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TSPAN19P0C672 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TSPAN19P0C672 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TSPAN19P0C672 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TSPAN19P0C672 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TSPAN19P0C672 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TSPAN19P0C672 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TSPAN19P0C672 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TSPAN19P0C672 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TSPAN19P0C672 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TSPAN19P0C672 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TSPAN19P0C672 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TSPAN19P0C672 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TSPAN19P0C672 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TSPAN19P0C672 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TSPAN19P0C672 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TSPAN19P0C672 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TSPAN19P0C672 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TSPAN19P0C672 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TSPAN19P0C672 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TSPAN19P0C672 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TSPAN19P0C672 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TSPAN19P0C672 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TSPAN19P0C672 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TSPAN19P0C672 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TSPAN19P0C672 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TSPAN19P0C672 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TSPAN19P0C672 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TSPAN19P0C672 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TSPAN19P0C672 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TSPAN19P0C672 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TSPAN19P0C672 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TSPAN19P0C672 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TSPAN19P0C672 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
TSPAN19P0C672 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TSPAN19P0C672 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TSPAN19P0C672 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TSPAN19P0C672 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TSPAN19P0C672 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TSPAN19P0C672 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TSPAN19P0C672 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TSPAN19P0C672 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
TSPAN19P0C672 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TSPAN19P0C672 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TSPAN19P0C672 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.7 ms