Protein–RNA interactions for Protein: P0C5Y4

KRTAP1-4, Keratin-associated protein 1-4, humanhuman

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP1-4P0C5Y4 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KRTAP1-4P0C5Y4 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KRTAP1-4P0C5Y4 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KRTAP1-4P0C5Y4 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KRTAP1-4P0C5Y4 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KRTAP1-4P0C5Y4 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KRTAP1-4P0C5Y4 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
KRTAP1-4P0C5Y4 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KRTAP1-4P0C5Y4 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KRTAP1-4P0C5Y4 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KRTAP1-4P0C5Y4 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KRTAP1-4P0C5Y4 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
KRTAP1-4P0C5Y4 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KRTAP1-4P0C5Y4 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KRTAP1-4P0C5Y4 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KRTAP1-4P0C5Y4 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KRTAP1-4P0C5Y4 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KRTAP1-4P0C5Y4 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
KRTAP1-4P0C5Y4 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRTAP1-4P0C5Y4 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
KRTAP1-4P0C5Y4 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KRTAP1-4P0C5Y4 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KRTAP1-4P0C5Y4 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KRTAP1-4P0C5Y4 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KRTAP1-4P0C5Y4 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KRTAP1-4P0C5Y4 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KRTAP1-4P0C5Y4 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KRTAP1-4P0C5Y4 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KRTAP1-4P0C5Y4 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KRTAP1-4P0C5Y4 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KRTAP1-4P0C5Y4 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KRTAP1-4P0C5Y4 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRTAP1-4P0C5Y4 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KRTAP1-4P0C5Y4 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KRTAP1-4P0C5Y4 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KRTAP1-4P0C5Y4 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRTAP1-4P0C5Y4 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
KRTAP1-4P0C5Y4 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRTAP1-4P0C5Y4 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRTAP1-4P0C5Y4 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRTAP1-4P0C5Y4 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRTAP1-4P0C5Y4 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
KRTAP1-4P0C5Y4 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRTAP1-4P0C5Y4 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRTAP1-4P0C5Y4 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KRTAP1-4P0C5Y4 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KRTAP1-4P0C5Y4 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KRTAP1-4P0C5Y4 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KRTAP1-4P0C5Y4 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KRTAP1-4P0C5Y4 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KRTAP1-4P0C5Y4 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KRTAP1-4P0C5Y4 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KRTAP1-4P0C5Y4 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRTAP1-4P0C5Y4 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRTAP1-4P0C5Y4 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRTAP1-4P0C5Y4 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRTAP1-4P0C5Y4 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRTAP1-4P0C5Y4 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
KRTAP1-4P0C5Y4 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRTAP1-4P0C5Y4 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRTAP1-4P0C5Y4 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRTAP1-4P0C5Y4 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRTAP1-4P0C5Y4 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRTAP1-4P0C5Y4 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRTAP1-4P0C5Y4 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRTAP1-4P0C5Y4 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KRTAP1-4P0C5Y4 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KRTAP1-4P0C5Y4 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KRTAP1-4P0C5Y4 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KRTAP1-4P0C5Y4 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KRTAP1-4P0C5Y4 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KRTAP1-4P0C5Y4 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KRTAP1-4P0C5Y4 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KRTAP1-4P0C5Y4 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRTAP1-4P0C5Y4 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRTAP1-4P0C5Y4 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRTAP1-4P0C5Y4 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRTAP1-4P0C5Y4 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRTAP1-4P0C5Y4 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRTAP1-4P0C5Y4 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRTAP1-4P0C5Y4 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRTAP1-4P0C5Y4 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KRTAP1-4P0C5Y4 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KRTAP1-4P0C5Y4 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KRTAP1-4P0C5Y4 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KRTAP1-4P0C5Y4 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KRTAP1-4P0C5Y4 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
KRTAP1-4P0C5Y4 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
KRTAP1-4P0C5Y4 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KRTAP1-4P0C5Y4 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KRTAP1-4P0C5Y4 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KRTAP1-4P0C5Y4 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KRTAP1-4P0C5Y4 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
KRTAP1-4P0C5Y4 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KRTAP1-4P0C5Y4 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KRTAP1-4P0C5Y4 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KRTAP1-4P0C5Y4 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KRTAP1-4P0C5Y4 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KRTAP1-4P0C5Y4 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KRTAP1-4P0C5Y4 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms