Protein–RNA interactions for Protein: P0C5Y4

KRTAP1-4, Keratin-associated protein 1-4, humanhuman

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP1-4P0C5Y4 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KRTAP1-4P0C5Y4 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRTAP1-4P0C5Y4 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KRTAP1-4P0C5Y4 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KRTAP1-4P0C5Y4 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
KRTAP1-4P0C5Y4 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
KRTAP1-4P0C5Y4 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KRTAP1-4P0C5Y4 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
KRTAP1-4P0C5Y4 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KRTAP1-4P0C5Y4 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
KRTAP1-4P0C5Y4 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
KRTAP1-4P0C5Y4 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KRTAP1-4P0C5Y4 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KRTAP1-4P0C5Y4 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KRTAP1-4P0C5Y4 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KRTAP1-4P0C5Y4 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KRTAP1-4P0C5Y4 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KRTAP1-4P0C5Y4 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KRTAP1-4P0C5Y4 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KRTAP1-4P0C5Y4 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KRTAP1-4P0C5Y4 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KRTAP1-4P0C5Y4 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
KRTAP1-4P0C5Y4 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KRTAP1-4P0C5Y4 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KRTAP1-4P0C5Y4 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KRTAP1-4P0C5Y4 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
KRTAP1-4P0C5Y4 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
KRTAP1-4P0C5Y4 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KRTAP1-4P0C5Y4 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KRTAP1-4P0C5Y4 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KRTAP1-4P0C5Y4 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KRTAP1-4P0C5Y4 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KRTAP1-4P0C5Y4 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KRTAP1-4P0C5Y4 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KRTAP1-4P0C5Y4 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KRTAP1-4P0C5Y4 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KRTAP1-4P0C5Y4 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KRTAP1-4P0C5Y4 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRTAP1-4P0C5Y4 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KRTAP1-4P0C5Y4 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KRTAP1-4P0C5Y4 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KRTAP1-4P0C5Y4 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KRTAP1-4P0C5Y4 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KRTAP1-4P0C5Y4 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KRTAP1-4P0C5Y4 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
KRTAP1-4P0C5Y4 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KRTAP1-4P0C5Y4 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KRTAP1-4P0C5Y4 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KRTAP1-4P0C5Y4 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KRTAP1-4P0C5Y4 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KRTAP1-4P0C5Y4 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KRTAP1-4P0C5Y4 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KRTAP1-4P0C5Y4 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
KRTAP1-4P0C5Y4 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KRTAP1-4P0C5Y4 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KRTAP1-4P0C5Y4 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KRTAP1-4P0C5Y4 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KRTAP1-4P0C5Y4 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
KRTAP1-4P0C5Y4 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KRTAP1-4P0C5Y4 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KRTAP1-4P0C5Y4 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KRTAP1-4P0C5Y4 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KRTAP1-4P0C5Y4 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KRTAP1-4P0C5Y4 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KRTAP1-4P0C5Y4 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KRTAP1-4P0C5Y4 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KRTAP1-4P0C5Y4 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KRTAP1-4P0C5Y4 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KRTAP1-4P0C5Y4 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KRTAP1-4P0C5Y4 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KRTAP1-4P0C5Y4 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KRTAP1-4P0C5Y4 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KRTAP1-4P0C5Y4 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KRTAP1-4P0C5Y4 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KRTAP1-4P0C5Y4 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KRTAP1-4P0C5Y4 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KRTAP1-4P0C5Y4 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KRTAP1-4P0C5Y4 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KRTAP1-4P0C5Y4 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KRTAP1-4P0C5Y4 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KRTAP1-4P0C5Y4 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KRTAP1-4P0C5Y4 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KRTAP1-4P0C5Y4 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KRTAP1-4P0C5Y4 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
KRTAP1-4P0C5Y4 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
KRTAP1-4P0C5Y4 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KRTAP1-4P0C5Y4 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KRTAP1-4P0C5Y4 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KRTAP1-4P0C5Y4 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KRTAP1-4P0C5Y4 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KRTAP1-4P0C5Y4 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KRTAP1-4P0C5Y4 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KRTAP1-4P0C5Y4 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KRTAP1-4P0C5Y4 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KRTAP1-4P0C5Y4 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KRTAP1-4P0C5Y4 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KRTAP1-4P0C5Y4 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KRTAP1-4P0C5Y4 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KRTAP1-4P0C5Y4 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KRTAP1-4P0C5Y4 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms