Protein–RNA interactions for Protein: P08648

ITGA5, Integrin alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA5P08648 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ITGA5P08648 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
ITGA5P08648 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.56
ITGA5P08648 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ITGA5P08648 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ITGA5P08648 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ITGA5P08648 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ITGA5P08648 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ITGA5P08648 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ITGA5P08648 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ITGA5P08648 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ITGA5P08648 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ITGA5P08648 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ITGA5P08648 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ITGA5P08648 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ITGA5P08648 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ITGA5P08648 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ITGA5P08648 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ITGA5P08648 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ITGA5P08648 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ITGA5P08648 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ITGA5P08648 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ITGA5P08648 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ITGA5P08648 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ITGA5P08648 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ITGA5P08648 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ITGA5P08648 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ITGA5P08648 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ITGA5P08648 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ITGA5P08648 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ITGA5P08648 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ITGA5P08648 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ITGA5P08648 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ITGA5P08648 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ITGA5P08648 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ITGA5P08648 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ITGA5P08648 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ITGA5P08648 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ITGA5P08648 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ITGA5P08648 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ITGA5P08648 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ITGA5P08648 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ITGA5P08648 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
ITGA5P08648 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ITGA5P08648 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ITGA5P08648 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ITGA5P08648 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ITGA5P08648 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ITGA5P08648 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ITGA5P08648 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ITGA5P08648 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ITGA5P08648 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ITGA5P08648 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ITGA5P08648 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ITGA5P08648 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ITGA5P08648 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ITGA5P08648 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ITGA5P08648 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ITGA5P08648 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ITGA5P08648 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ITGA5P08648 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ITGA5P08648 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ITGA5P08648 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ITGA5P08648 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ITGA5P08648 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ITGA5P08648 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ITGA5P08648 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ITGA5P08648 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ITGA5P08648 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ITGA5P08648 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ITGA5P08648 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ITGA5P08648 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ITGA5P08648 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ITGA5P08648 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ITGA5P08648 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ITGA5P08648 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ITGA5P08648 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ITGA5P08648 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ITGA5P08648 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ITGA5P08648 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ITGA5P08648 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ITGA5P08648 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ITGA5P08648 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ITGA5P08648 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ITGA5P08648 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ITGA5P08648 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ITGA5P08648 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ITGA5P08648 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ITGA5P08648 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ITGA5P08648 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ITGA5P08648 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ITGA5P08648 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ITGA5P08648 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ITGA5P08648 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ITGA5P08648 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ITGA5P08648 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ITGA5P08648 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ITGA5P08648 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ITGA5P08648 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ITGA5P08648 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms