Protein–RNA interactions for Protein: P05000

IFNW1, Interferon omega-1, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNW1P05000 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
IFNW1P05000 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
IFNW1P05000 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
IFNW1P05000 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
IFNW1P05000 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
IFNW1P05000 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
IFNW1P05000 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
IFNW1P05000 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
IFNW1P05000 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
IFNW1P05000 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
IFNW1P05000 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
IFNW1P05000 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
IFNW1P05000 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
IFNW1P05000 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
IFNW1P05000 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
IFNW1P05000 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
IFNW1P05000 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.69
IFNW1P05000 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
IFNW1P05000 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
IFNW1P05000 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
IFNW1P05000 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
IFNW1P05000 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
IFNW1P05000 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
IFNW1P05000 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
IFNW1P05000 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
IFNW1P05000 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
IFNW1P05000 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
IFNW1P05000 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
IFNW1P05000 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
IFNW1P05000 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
IFNW1P05000 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
IFNW1P05000 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
IFNW1P05000 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
IFNW1P05000 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
IFNW1P05000 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
IFNW1P05000 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
IFNW1P05000 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
IFNW1P05000 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
IFNW1P05000 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
IFNW1P05000 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
IFNW1P05000 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
IFNW1P05000 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
IFNW1P05000 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
IFNW1P05000 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
IFNW1P05000 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
IFNW1P05000 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
IFNW1P05000 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
IFNW1P05000 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
IFNW1P05000 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
IFNW1P05000 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
IFNW1P05000 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
IFNW1P05000 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
IFNW1P05000 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
IFNW1P05000 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
IFNW1P05000 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
IFNW1P05000 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
IFNW1P05000 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
IFNW1P05000 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
IFNW1P05000 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
IFNW1P05000 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
IFNW1P05000 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
IFNW1P05000 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
IFNW1P05000 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
IFNW1P05000 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
IFNW1P05000 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
IFNW1P05000 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
IFNW1P05000 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
IFNW1P05000 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
IFNW1P05000 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
IFNW1P05000 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
IFNW1P05000 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
IFNW1P05000 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
IFNW1P05000 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
IFNW1P05000 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
IFNW1P05000 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
IFNW1P05000 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
IFNW1P05000 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
IFNW1P05000 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
IFNW1P05000 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
IFNW1P05000 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
IFNW1P05000 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
IFNW1P05000 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
IFNW1P05000 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IFNW1P05000 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IFNW1P05000 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
IFNW1P05000 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
IFNW1P05000 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
IFNW1P05000 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IFNW1P05000 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
IFNW1P05000 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
IFNW1P05000 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
IFNW1P05000 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
IFNW1P05000 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
IFNW1P05000 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
IFNW1P05000 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
IFNW1P05000 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
IFNW1P05000 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
IFNW1P05000 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
IFNW1P05000 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
IFNW1P05000 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms