Protein–RNA interactions for Protein: P04818

TYMS, Thymidylate synthase, humanhuman

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TYMSP04818 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TYMSP04818 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TYMSP04818 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TYMSP04818 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TYMSP04818 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TYMSP04818 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TYMSP04818 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TYMSP04818 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TYMSP04818 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TYMSP04818 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TYMSP04818 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TYMSP04818 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TYMSP04818 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TYMSP04818 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TYMSP04818 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TYMSP04818 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TYMSP04818 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TYMSP04818 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TYMSP04818 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TYMSP04818 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TYMSP04818 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TYMSP04818 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TYMSP04818 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TYMSP04818 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TYMSP04818 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TYMSP04818 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TYMSP04818 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TYMSP04818 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TYMSP04818 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TYMSP04818 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TYMSP04818 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TYMSP04818 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TYMSP04818 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TYMSP04818 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TYMSP04818 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TYMSP04818 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TYMSP04818 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TYMSP04818 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TYMSP04818 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TYMSP04818 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TYMSP04818 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TYMSP04818 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TYMSP04818 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TYMSP04818 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TYMSP04818 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TYMSP04818 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TYMSP04818 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TYMSP04818 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TYMSP04818 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TYMSP04818 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TYMSP04818 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TYMSP04818 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TYMSP04818 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TYMSP04818 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TYMSP04818 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TYMSP04818 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TYMSP04818 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TYMSP04818 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TYMSP04818 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TYMSP04818 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TYMSP04818 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TYMSP04818 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TYMSP04818 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TYMSP04818 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TYMSP04818 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TYMSP04818 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TYMSP04818 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TYMSP04818 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TYMSP04818 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TYMSP04818 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TYMSP04818 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
TYMSP04818 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TYMSP04818 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TYMSP04818 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TYMSP04818 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TYMSP04818 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TYMSP04818 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TYMSP04818 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TYMSP04818 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TYMSP04818 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TYMSP04818 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TYMSP04818 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TYMSP04818 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TYMSP04818 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TYMSP04818 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TYMSP04818 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TYMSP04818 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TYMSP04818 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TYMSP04818 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TYMSP04818 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TYMSP04818 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TYMSP04818 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TYMSP04818 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TYMSP04818 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TYMSP04818 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TYMSP04818 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TYMSP04818 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TYMSP04818 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TYMSP04818 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
TYMSP04818 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms