Protein–RNA interactions for Protein: P02748

C9, Complement component C9, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9P02748 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
C9P02748 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
C9P02748 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
C9P02748 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
C9P02748 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
C9P02748 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
C9P02748 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
C9P02748 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
C9P02748 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
C9P02748 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
C9P02748 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
C9P02748 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
C9P02748 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
C9P02748 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
C9P02748 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
C9P02748 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
C9P02748 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
C9P02748 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
C9P02748 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
C9P02748 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
C9P02748 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
C9P02748 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
C9P02748 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
C9P02748 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
C9P02748 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
C9P02748 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
C9P02748 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
C9P02748 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
C9P02748 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
C9P02748 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
C9P02748 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
C9P02748 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
C9P02748 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
C9P02748 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
C9P02748 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
C9P02748 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
C9P02748 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
C9P02748 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
C9P02748 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
C9P02748 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
C9P02748 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
C9P02748 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
C9P02748 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
C9P02748 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
C9P02748 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
C9P02748 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
C9P02748 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
C9P02748 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
C9P02748 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
C9P02748 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
C9P02748 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
C9P02748 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
C9P02748 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
C9P02748 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
C9P02748 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
C9P02748 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
C9P02748 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
C9P02748 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
C9P02748 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
C9P02748 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
C9P02748 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
C9P02748 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
C9P02748 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
C9P02748 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
C9P02748 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
C9P02748 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
C9P02748 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
C9P02748 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
C9P02748 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
C9P02748 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
C9P02748 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
C9P02748 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
C9P02748 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
C9P02748 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
C9P02748 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
C9P02748 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
C9P02748 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
C9P02748 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
C9P02748 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
C9P02748 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
C9P02748 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
C9P02748 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
C9P02748 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
C9P02748 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
C9P02748 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
C9P02748 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
C9P02748 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
C9P02748 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
C9P02748 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
C9P02748 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
C9P02748 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
C9P02748 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
C9P02748 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
C9P02748 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
C9P02748 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
C9P02748 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
C9P02748 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
C9P02748 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
C9P02748 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
C9P02748 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms