Protein–RNA interactions for Protein: P00918

CA2, Carbonic anhydrase 2, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA2P00918 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CA2P00918 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CA2P00918 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CA2P00918 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CA2P00918 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CA2P00918 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CA2P00918 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CA2P00918 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CA2P00918 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CA2P00918 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CA2P00918 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CA2P00918 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CA2P00918 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CA2P00918 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CA2P00918 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CA2P00918 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CA2P00918 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CA2P00918 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CA2P00918 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CA2P00918 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CA2P00918 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CA2P00918 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CA2P00918 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CA2P00918 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CA2P00918 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CA2P00918 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CA2P00918 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CA2P00918 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CA2P00918 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CA2P00918 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CA2P00918 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CA2P00918 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CA2P00918 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CA2P00918 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CA2P00918 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CA2P00918 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CA2P00918 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CA2P00918 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CA2P00918 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CA2P00918 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CA2P00918 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CA2P00918 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CA2P00918 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CA2P00918 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CA2P00918 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CA2P00918 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CA2P00918 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CA2P00918 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CA2P00918 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CA2P00918 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CA2P00918 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CA2P00918 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CA2P00918 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CA2P00918 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CA2P00918 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CA2P00918 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CA2P00918 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CA2P00918 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CA2P00918 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CA2P00918 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CA2P00918 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CA2P00918 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CA2P00918 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CA2P00918 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CA2P00918 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CA2P00918 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CA2P00918 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CA2P00918 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CA2P00918 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CA2P00918 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CA2P00918 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CA2P00918 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CA2P00918 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CA2P00918 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CA2P00918 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CA2P00918 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CA2P00918 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CA2P00918 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CA2P00918 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CA2P00918 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CA2P00918 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CA2P00918 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CA2P00918 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CA2P00918 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CA2P00918 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CA2P00918 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CA2P00918 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CA2P00918 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CA2P00918 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CA2P00918 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CA2P00918 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CA2P00918 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CA2P00918 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CA2P00918 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CA2P00918 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CA2P00918 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CA2P00918 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CA2P00918 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CA2P00918 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CA2P00918 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms