Protein–RNA interactions for Protein: O96019

ACTL6A, Actin-like protein 6A, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTL6AO96019 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
ACTL6AO96019 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ACTL6AO96019 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ACTL6AO96019 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ACTL6AO96019 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ACTL6AO96019 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ACTL6AO96019 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
ACTL6AO96019 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ACTL6AO96019 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ACTL6AO96019 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ACTL6AO96019 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ACTL6AO96019 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ACTL6AO96019 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ACTL6AO96019 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ACTL6AO96019 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ACTL6AO96019 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ACTL6AO96019 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ACTL6AO96019 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ACTL6AO96019 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ACTL6AO96019 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ACTL6AO96019 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
ACTL6AO96019 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ACTL6AO96019 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ACTL6AO96019 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ACTL6AO96019 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ACTL6AO96019 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ACTL6AO96019 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ACTL6AO96019 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ACTL6AO96019 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ACTL6AO96019 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ACTL6AO96019 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ACTL6AO96019 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ACTL6AO96019 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ACTL6AO96019 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ACTL6AO96019 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ACTL6AO96019 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ACTL6AO96019 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ACTL6AO96019 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ACTL6AO96019 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ACTL6AO96019 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ACTL6AO96019 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ACTL6AO96019 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ACTL6AO96019 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ACTL6AO96019 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ACTL6AO96019 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ACTL6AO96019 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ACTL6AO96019 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
ACTL6AO96019 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
ACTL6AO96019 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ACTL6AO96019 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ACTL6AO96019 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ACTL6AO96019 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ACTL6AO96019 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ACTL6AO96019 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ACTL6AO96019 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ACTL6AO96019 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ACTL6AO96019 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ACTL6AO96019 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ACTL6AO96019 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ACTL6AO96019 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ACTL6AO96019 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ACTL6AO96019 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ACTL6AO96019 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ACTL6AO96019 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ACTL6AO96019 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ACTL6AO96019 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ACTL6AO96019 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ACTL6AO96019 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ACTL6AO96019 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ACTL6AO96019 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ACTL6AO96019 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ACTL6AO96019 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ACTL6AO96019 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ACTL6AO96019 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ACTL6AO96019 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ACTL6AO96019 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ACTL6AO96019 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ACTL6AO96019 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ACTL6AO96019 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ACTL6AO96019 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ACTL6AO96019 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ACTL6AO96019 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ACTL6AO96019 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ACTL6AO96019 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ACTL6AO96019 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ACTL6AO96019 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ACTL6AO96019 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ACTL6AO96019 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ACTL6AO96019 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ACTL6AO96019 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ACTL6AO96019 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
ACTL6AO96019 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ACTL6AO96019 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ACTL6AO96019 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ACTL6AO96019 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ACTL6AO96019 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ACTL6AO96019 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
ACTL6AO96019 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ACTL6AO96019 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ACTL6AO96019 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 135.2 ms