Protein–RNA interactions for Protein: O95630

STAMBP, STAM-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAMBPO95630 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
STAMBPO95630 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
STAMBPO95630 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
STAMBPO95630 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
STAMBPO95630 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
STAMBPO95630 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
STAMBPO95630 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
STAMBPO95630 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
STAMBPO95630 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
STAMBPO95630 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
STAMBPO95630 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
STAMBPO95630 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
STAMBPO95630 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
STAMBPO95630 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
STAMBPO95630 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
STAMBPO95630 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
STAMBPO95630 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
STAMBPO95630 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
STAMBPO95630 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
STAMBPO95630 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
STAMBPO95630 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
STAMBPO95630 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
STAMBPO95630 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
STAMBPO95630 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
STAMBPO95630 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
STAMBPO95630 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
STAMBPO95630 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
STAMBPO95630 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
STAMBPO95630 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
STAMBPO95630 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
STAMBPO95630 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
STAMBPO95630 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
STAMBPO95630 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
STAMBPO95630 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
STAMBPO95630 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
STAMBPO95630 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
STAMBPO95630 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
STAMBPO95630 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
STAMBPO95630 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
STAMBPO95630 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
STAMBPO95630 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
STAMBPO95630 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
STAMBPO95630 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
STAMBPO95630 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
STAMBPO95630 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
STAMBPO95630 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
STAMBPO95630 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
STAMBPO95630 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
STAMBPO95630 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
STAMBPO95630 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
STAMBPO95630 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
STAMBPO95630 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
STAMBPO95630 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
STAMBPO95630 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
STAMBPO95630 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
STAMBPO95630 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
STAMBPO95630 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
STAMBPO95630 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
STAMBPO95630 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
STAMBPO95630 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
STAMBPO95630 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
STAMBPO95630 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
STAMBPO95630 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
STAMBPO95630 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
STAMBPO95630 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
STAMBPO95630 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
STAMBPO95630 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
STAMBPO95630 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
STAMBPO95630 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
STAMBPO95630 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
STAMBPO95630 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
STAMBPO95630 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
STAMBPO95630 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
STAMBPO95630 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
STAMBPO95630 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
STAMBPO95630 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
STAMBPO95630 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
STAMBPO95630 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
STAMBPO95630 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
STAMBPO95630 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
STAMBPO95630 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
STAMBPO95630 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
STAMBPO95630 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
STAMBPO95630 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
STAMBPO95630 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
STAMBPO95630 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
STAMBPO95630 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
STAMBPO95630 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
STAMBPO95630 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
STAMBPO95630 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
STAMBPO95630 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
STAMBPO95630 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
STAMBPO95630 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
STAMBPO95630 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
STAMBPO95630 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
STAMBPO95630 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
STAMBPO95630 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
STAMBPO95630 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
STAMBPO95630 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
STAMBPO95630 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms