Protein–RNA interactions for Protein: O95630

STAMBP, STAM-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAMBPO95630 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
STAMBPO95630 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC31.87■■■□□ 2.69
STAMBPO95630 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.68
STAMBPO95630 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
STAMBPO95630 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
STAMBPO95630 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
STAMBPO95630 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
STAMBPO95630 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC30.69■■■□□ 2.5
STAMBPO95630 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
STAMBPO95630 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
STAMBPO95630 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
STAMBPO95630 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC30.63■■■□□ 2.49
STAMBPO95630 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC30.45■■■□□ 2.47
STAMBPO95630 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
STAMBPO95630 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
STAMBPO95630 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
STAMBPO95630 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
STAMBPO95630 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
STAMBPO95630 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
STAMBPO95630 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
STAMBPO95630 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
STAMBPO95630 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
STAMBPO95630 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
STAMBPO95630 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
STAMBPO95630 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
STAMBPO95630 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
STAMBPO95630 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
STAMBPO95630 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
STAMBPO95630 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
STAMBPO95630 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
STAMBPO95630 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
STAMBPO95630 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
STAMBPO95630 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
STAMBPO95630 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
STAMBPO95630 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
STAMBPO95630 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
STAMBPO95630 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
STAMBPO95630 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
STAMBPO95630 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
STAMBPO95630 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
STAMBPO95630 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
STAMBPO95630 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
STAMBPO95630 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
STAMBPO95630 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
STAMBPO95630 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
STAMBPO95630 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
STAMBPO95630 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
STAMBPO95630 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
STAMBPO95630 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
STAMBPO95630 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
STAMBPO95630 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
STAMBPO95630 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
STAMBPO95630 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
STAMBPO95630 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
STAMBPO95630 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
STAMBPO95630 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
STAMBPO95630 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
STAMBPO95630 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
STAMBPO95630 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
STAMBPO95630 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
STAMBPO95630 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
STAMBPO95630 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
STAMBPO95630 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
STAMBPO95630 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
STAMBPO95630 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
STAMBPO95630 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
STAMBPO95630 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
STAMBPO95630 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.11
STAMBPO95630 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
STAMBPO95630 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
STAMBPO95630 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
STAMBPO95630 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
STAMBPO95630 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
STAMBPO95630 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
STAMBPO95630 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
STAMBPO95630 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
STAMBPO95630 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
STAMBPO95630 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
STAMBPO95630 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
STAMBPO95630 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
STAMBPO95630 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
STAMBPO95630 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
STAMBPO95630 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
STAMBPO95630 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
STAMBPO95630 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
STAMBPO95630 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
STAMBPO95630 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
STAMBPO95630 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
STAMBPO95630 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
STAMBPO95630 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
STAMBPO95630 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
STAMBPO95630 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
STAMBPO95630 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
STAMBPO95630 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
STAMBPO95630 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
STAMBPO95630 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
STAMBPO95630 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
STAMBPO95630 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
STAMBPO95630 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
STAMBPO95630 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms