Protein–RNA interactions for Protein: O94889

KLHL18, Kelch-like protein 18, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL18O94889 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
KLHL18O94889 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
KLHL18O94889 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KLHL18O94889 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KLHL18O94889 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KLHL18O94889 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
KLHL18O94889 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
KLHL18O94889 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KLHL18O94889 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KLHL18O94889 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
KLHL18O94889 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
KLHL18O94889 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
KLHL18O94889 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
KLHL18O94889 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
KLHL18O94889 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
KLHL18O94889 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
KLHL18O94889 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
KLHL18O94889 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
KLHL18O94889 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
KLHL18O94889 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
KLHL18O94889 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
KLHL18O94889 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
KLHL18O94889 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
KLHL18O94889 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
KLHL18O94889 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
KLHL18O94889 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
KLHL18O94889 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
KLHL18O94889 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
KLHL18O94889 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
KLHL18O94889 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
KLHL18O94889 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KLHL18O94889 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
KLHL18O94889 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
KLHL18O94889 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
KLHL18O94889 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
KLHL18O94889 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
KLHL18O94889 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
KLHL18O94889 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
KLHL18O94889 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
KLHL18O94889 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
KLHL18O94889 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
KLHL18O94889 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
KLHL18O94889 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
KLHL18O94889 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
KLHL18O94889 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
KLHL18O94889 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
KLHL18O94889 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
KLHL18O94889 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
KLHL18O94889 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
KLHL18O94889 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
KLHL18O94889 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
KLHL18O94889 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
KLHL18O94889 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
KLHL18O94889 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
KLHL18O94889 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
KLHL18O94889 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
KLHL18O94889 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
KLHL18O94889 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
KLHL18O94889 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
KLHL18O94889 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
KLHL18O94889 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
KLHL18O94889 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
KLHL18O94889 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
KLHL18O94889 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
KLHL18O94889 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
KLHL18O94889 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
KLHL18O94889 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
KLHL18O94889 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
KLHL18O94889 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.29■■□□□ 1.8
KLHL18O94889 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
KLHL18O94889 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
KLHL18O94889 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
KLHL18O94889 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KLHL18O94889 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
KLHL18O94889 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
KLHL18O94889 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
KLHL18O94889 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
KLHL18O94889 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
KLHL18O94889 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
KLHL18O94889 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
KLHL18O94889 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KLHL18O94889 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
KLHL18O94889 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KLHL18O94889 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
KLHL18O94889 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
KLHL18O94889 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KLHL18O94889 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KLHL18O94889 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
KLHL18O94889 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
KLHL18O94889 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
KLHL18O94889 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
KLHL18O94889 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
KLHL18O94889 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
KLHL18O94889 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KLHL18O94889 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
KLHL18O94889 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KLHL18O94889 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KLHL18O94889 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KLHL18O94889 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KLHL18O94889 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms