Protein–RNA interactions for Protein: O94769

ECM2, Extracellular matrix protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM2O94769 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC32.64■■■□□ 2.82
ECM2O94769 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC32.63■■■□□ 2.81
ECM2O94769 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
ECM2O94769 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
ECM2O94769 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
ECM2O94769 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
ECM2O94769 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
ECM2O94769 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
ECM2O94769 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC32.6■■■□□ 2.81
ECM2O94769 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC32.59■■■□□ 2.81
ECM2O94769 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
ECM2O94769 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
ECM2O94769 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
ECM2O94769 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
ECM2O94769 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
ECM2O94769 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
ECM2O94769 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
ECM2O94769 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
ECM2O94769 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
ECM2O94769 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
ECM2O94769 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
ECM2O94769 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC32.45■■■□□ 2.79
ECM2O94769 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
ECM2O94769 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
ECM2O94769 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
ECM2O94769 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
ECM2O94769 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC32.42■■■□□ 2.78
ECM2O94769 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
ECM2O94769 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
ECM2O94769 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
ECM2O94769 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
ECM2O94769 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC32.36■■■□□ 2.77
ECM2O94769 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
ECM2O94769 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
ECM2O94769 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
ECM2O94769 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
ECM2O94769 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
ECM2O94769 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
ECM2O94769 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
ECM2O94769 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC32.32■■■□□ 2.76
ECM2O94769 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
ECM2O94769 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
ECM2O94769 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
ECM2O94769 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
ECM2O94769 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
ECM2O94769 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC32.24■■■□□ 2.75
ECM2O94769 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
ECM2O94769 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC32.19■■■□□ 2.74
ECM2O94769 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
ECM2O94769 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
ECM2O94769 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.17■■■□□ 2.74
ECM2O94769 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
ECM2O94769 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
ECM2O94769 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
ECM2O94769 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
ECM2O94769 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.73
ECM2O94769 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.73
ECM2O94769 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
ECM2O94769 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
ECM2O94769 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
ECM2O94769 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC32.12■■■□□ 2.73
ECM2O94769 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
ECM2O94769 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC32.12■■■□□ 2.73
ECM2O94769 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
ECM2O94769 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
ECM2O94769 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
ECM2O94769 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
ECM2O94769 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
ECM2O94769 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
ECM2O94769 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
ECM2O94769 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC32.01■■■□□ 2.71
ECM2O94769 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC32.01■■■□□ 2.71
ECM2O94769 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC32.01■■■□□ 2.71
ECM2O94769 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
ECM2O94769 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
ECM2O94769 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
ECM2O94769 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
ECM2O94769 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
ECM2O94769 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
ECM2O94769 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC31.94■■■□□ 2.7
ECM2O94769 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.94■■■□□ 2.7
ECM2O94769 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
ECM2O94769 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
ECM2O94769 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
ECM2O94769 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
ECM2O94769 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
ECM2O94769 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC31.9■■■□□ 2.7
ECM2O94769 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
ECM2O94769 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
ECM2O94769 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC31.86■■■□□ 2.69
ECM2O94769 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
ECM2O94769 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC31.83■■■□□ 2.69
ECM2O94769 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.68
ECM2O94769 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.68
ECM2O94769 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC31.81■■■□□ 2.68
ECM2O94769 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
ECM2O94769 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
ECM2O94769 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
ECM2O94769 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
ECM2O94769 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms